87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1778 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1778  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000166899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4395  hypothetical protein  42.65 
 
 		 251 aa  193  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1597  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.11 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1775  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.11 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1684  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.11 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1745  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.11 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.504585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1682  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.11 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2091  formate dehydrogenase gamma subunit  26.34 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2087  hypothetical protein  25.22 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000659531  hitchhiker  0.0000000000148039 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1284  formate dehydrogenase-N subunit gamma  26.01 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.43156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1752  formate dehydrogenase-N subunit gamma  25.23 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.125669  hitchhiker  0.000744815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3047  formate dehydrogenase-N subunit gamma  26.01 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1333  formate dehydrogenase-N subunit gamma  25.69 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1559  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.11 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1739  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.11 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.351233  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1658  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.11 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2181  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.11 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1698  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.11 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01434  formate dehydrogenase-N, cytochrome B556 (gamma) subunit, nitrate-inducible  24.11 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2171  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.11 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2088  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.11 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01446  hypothetical protein  24.11 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  22.84 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0544  iron-sulfur cluster-binding protein  38.6 
 
 		 479 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0099  formate dehydrogenase gamma subunit  24.67 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2660  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.89 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.485157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0103  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, cytochrome b556 subunit  24.34 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0104  formate dehydrogenase gamma subunit  24.67 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0104  formate dehydrogenase gamma subunit  24.67 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2827  formate dehydrogenase, gamma subunit  30.45 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.501112  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3812  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.66 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3756  formate dehydrogenase gamma subunit  25.11 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3896  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.66 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0440  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.25 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2052  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.11 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.691652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03830  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.27 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0107  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.21 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4269  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.83 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308563  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0106  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.52 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0102  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.52 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0243  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 		 529 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.312499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2336  formate dehydrogenase gamma subunit  22.65 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.723504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0452  formate dehydrogenase gamma subunit  25.69 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1693  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.86 
 
 		 591 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2010  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.82 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.35539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4270  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.2 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4248  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.2 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.661793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4361  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.2 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4315  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.2 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4426  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.2 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  24.32 
 
 		 757 aa  48.9  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  24.63 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  24.63 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  24.63 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4371  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.66 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4087  formate dehydrogenase-O subunit gamma  25.62 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0680  formate dehydrogenase gamma subunit  28.33 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3725  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.26 
 
 		 384 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.455366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.11 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03726  hypothetical protein  24.2 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4278  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.2 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5342  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.2 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.412643 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03777  formate dehydrogenase-O, cytochrome b556 subunit  24.2 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4126  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.2 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4092  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.2 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0394  formate dehydrogenase gamma subunit  28.57 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.041193 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4421  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.2 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4120  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.2 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2640  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.23 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.174669 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0165  iron-sulfur cluster-binding protein  36.76 
 
 		 153 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0184855  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2865  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.58 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1573  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.32 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1816  formate dehydrogenase gamma subunit  26.94 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.621402  normal  0.0631982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3372  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.31 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  30 
 
 		 696 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0301  hypothetical protein  30.16 
 
 		 154 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2551  formate dehydrogenase gamma subunit  26.2 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233004  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3258  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.55 
 
 		 396 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.263075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2700  formate dehydrogenase gamma subunit  24.03 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604172  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3263  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.09 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0259  hypothetical protein  24.37 
 
 		 295 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1360  iron-sulfur cluster-binding protein  22.73 
 
 		 142 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0685  formate dehydrogenase gamma subunit  24.66 
 
 		 398 aa  42  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368293  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  22.39 
 
 		 247 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6558  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.11 
 
 		 218 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892588  hitchhiker  0.000719745 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1823  formate dehydrogenase gamma subunit  26.89 
 
 		 219 aa  41.6  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1208  formate dehydrogenase, gamma subunit, putative  21.82 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>