56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0377 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0377  cytochrome b561  100 
 
 		 199 aa  403  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3141  cytochrome B561  54.55 
 
 		 218 aa  228  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3634  cytochrome B561  54.08 
 
 		 208 aa  221  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.430483  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0878  cytochrome B561  59.18 
 
 		 197 aa  215  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0580408  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0148  cytochrome b561  55.84 
 
 		 198 aa  207  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0241  cytochrome B561  53.77 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0540804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1695  cytochrome B561  50.25 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0166  cytochrome B561  49.75 
 
 		 213 aa  184  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304607  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3004  cytochrome B561  45.96 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0455486  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0091  cytochrome B561  46.94 
 
 		 222 aa  181  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000871818 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1393  cytochrome B561  49.47 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2159  cytochrome B561  42.29 
 
 		 201 aa  174  8e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.862051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2065  cytochrome B561  41.29 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2105  cytochrome B561  41.29 
 
 		 201 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2425  cytochrome B561  41.29 
 
 		 201 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1964  cytochrome B561  41.79 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156226  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1198  hydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  40.3 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2186  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  36.17 
 
 		 254 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2233  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  35.64 
 
 		 254 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0108837  normal  0.187454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2240  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  35.64 
 
 		 254 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.728815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2286  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  35.64 
 
 		 254 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.08232 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2399  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  35.64 
 
 		 254 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.356417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  30.85 
 
 		 224 aa  85.1  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  31.34 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2713  cytochrome B561  31.25 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  30.41 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0690  cytochrome B561  29.02 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0677  cytochrome B561  30.26 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  27.55 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2383  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.49 
 
 		 261 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00487401  hitchhiker  0.000175861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1527  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.49 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  hitchhiker  0.0000439849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1885  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.01 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1870  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.01 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.26404  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1972  cytochrome B561  26.54 
 
 		 261 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01639  predicted cytochrome  26.54 
 
 		 261 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.467197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01629  hypothetical protein  26.54 
 
 		 261 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.5046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1961  cytochrome B561  27.01 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190116 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0283  cytochrome B561  27.14 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1751  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.01 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000335774  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0938  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  27.14 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4395  hypothetical protein  26.67 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0863  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  28.57 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.627078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5280  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.96 
 
 		 339 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3770  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.27 
 
 		 244 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.73 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1164  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.09 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3089  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.14 
 
 		 339 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971342  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1901  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  26.19 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08530  Ni,Fe-hydrogenase I cytochrome b subunit  23.78 
 
 		 229 aa  42  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.360929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0459  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.65 
 
 		 345 aa  42  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3205  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.12 
 
 		 345 aa  42  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2406  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.45 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0991035  hitchhiker  0.000275557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1887  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.45 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1913  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.45 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.400664  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1920  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.45 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1434  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  25.11 
 
 		 243 aa  41.2  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.237376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>