59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1393 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1393  cytochrome B561  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3004  cytochrome B561  61.32 
 
 		 215 aa  278  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0455486  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0091  cytochrome B561  59.13 
 
 		 222 aa  259  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000871818 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1695  cytochrome B561  58.05 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0166  cytochrome B561  57.82 
 
 		 213 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304607  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0241  cytochrome B561  60.61 
 
 		 202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0540804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3141  cytochrome B561  48.58 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3634  cytochrome B561  52.76 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.430483  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0377  cytochrome b561  48.73 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2159  cytochrome B561  49.5 
 
 		 201 aa  195  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.862051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1198  hydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  47 
 
 		 201 aa  191  8e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2425  cytochrome B561  47.5 
 
 		 201 aa  188  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1964  cytochrome B561  50.74 
 
 		 201 aa  185  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156226  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2105  cytochrome B561  48.5 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2065  cytochrome B561  48 
 
 		 201 aa  184  9e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0878  cytochrome B561  46.15 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0580408  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0148  cytochrome b561  43.94 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  33.01 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  33.49 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  30.73 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2713  cytochrome B561  31.36 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0677  cytochrome B561  30.58 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0690  cytochrome B561  29.95 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  32.74 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2186  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  31.66 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2233  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  32.16 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0108837  normal  0.187454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2286  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  32.16 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.08232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2240  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  32.16 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.728815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2399  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  32.16 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.356417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1527  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.71 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  hitchhiker  0.0000439849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1885  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.21 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2383  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.71 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00487401  hitchhiker  0.000175861 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1961  cytochrome B561  27.72 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190116 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1751  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.72 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000335774  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1972  cytochrome B561  28.22 
 
 		 261 aa  62  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01639  predicted cytochrome  28.22 
 
 		 261 aa  62  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.467197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01629  hypothetical protein  28.22 
 
 		 261 aa  62  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.5046  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1870  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.72 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.26404  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0283  cytochrome B561  28.71 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1156  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.77 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  33.33 
 
 		 280 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3662  formate dehydrogenase gamma subunit  27.81 
 
 		 321 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  32.67 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1367  cytochrome B561  25 
 
 		 390 aa  48.5  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.01 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4059  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.15 
 
 		 408 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1276  cytochrome B561  26.87 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2916  cytochrome B561  25 
 
 		 390 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.494489 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0283  formate dehydrogenase gamma subunit  27.27 
 
 		 321 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1164  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  22.94 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3770  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  24.66 
 
 		 244 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2130  cytochrome B561  25.71 
 
 		 390 aa  45.4  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.578698  normal  0.698297 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1682  formate dehydrogenase, cytochrome b subunit  25.96 
 
 		 310 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1173  formate dehydrogenase gamma subunit  24.66 
 
 		 388 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601281  normal  0.202143 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1501  formate dehydrogenase, cytochrome b subunit  27.01 
 
 		 310 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1861  formate dehydrogenase, cytochrome b subunit  27.01 
 
 		 310 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0336  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.89 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00129504  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3706  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.17 
 
 		 340 aa  41.6  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02280  formate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  26.05 
 
 		 350 aa  41.6  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>