44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2425 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2425  cytochrome B561  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2159  cytochrome B561  88.06 
 
 		 201 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.862051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1964  cytochrome B561  85.57 
 
 		 201 aa  363  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156226  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1198  hydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  82.59 
 
 		 201 aa  359  2e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2065  cytochrome B561  80.1 
 
 		 201 aa  337  5.9999999999999996e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2105  cytochrome B561  79.6 
 
 		 201 aa  337  8e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1695  cytochrome B561  47.76 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0241  cytochrome B561  48.76 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0540804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0166  cytochrome B561  46.27 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304607  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3004  cytochrome B561  46.8 
 
 		 215 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0455486  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3634  cytochrome B561  42.71 
 
 		 208 aa  177  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.430483  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3141  cytochrome B561  40.3 
 
 		 218 aa  171  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0091  cytochrome B561  43.35 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000871818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0377  cytochrome b561  41.29 
 
 		 199 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1393  cytochrome B561  46.11 
 
 		 213 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0878  cytochrome B561  40 
 
 		 197 aa  137  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0580408  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0148  cytochrome b561  36.63 
 
 		 198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2186  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  34.18 
 
 		 254 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  28.64 
 
 		 214 aa  98.6  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  31.37 
 
 		 224 aa  92  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2233  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  34.18 
 
 		 254 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0108837  normal  0.187454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2286  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  33.67 
 
 		 254 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.08232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2240  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  33.67 
 
 		 254 aa  87.8  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.728815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2713  cytochrome B561  29.13 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  30.39 
 
 		 218 aa  85.9  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2399  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  33.16 
 
 		 254 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.356417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0677  cytochrome B561  30.24 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0690  cytochrome B561  29.76 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204207 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0283  cytochrome B561  31.34 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  28.92 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1527  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.24 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  hitchhiker  0.0000439849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1870  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.7 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.26404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01639  predicted cytochrome  29.21 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.467197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01629  hypothetical protein  29.21 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.5046  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1972  cytochrome B561  29.21 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1885  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.9 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1961  cytochrome B561  29.21 
 
 		 261 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190116 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1751  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.21 
 
 		 261 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000335774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2383  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.27 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00487401  hitchhiker  0.000175861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.7 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0938  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  26.98 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2451  formate dehydrogenase gamma subunit  25.7 
 
 		 339 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779662  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0052  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25 
 
 		 231 aa  42  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.036623  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2175  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.32 
 
 		 250 aa  41.6  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000847396  normal  0.136379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>