54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0091 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0091  cytochrome B561  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000871818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3004  cytochrome B561  66.82 
 
 		 215 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0455486  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0166  cytochrome B561  53.74 
 
 		 213 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304607  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1695  cytochrome B561  56.59 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0241  cytochrome B561  57.36 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0540804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1393  cytochrome B561  60.85 
 
 		 213 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3141  cytochrome B561  47.42 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3634  cytochrome B561  46.73 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.430483  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0377  cytochrome b561  46.94 
 
 		 199 aa  181  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1198  hydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  43.78 
 
 		 201 aa  180  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2159  cytochrome B561  45.81 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.862051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2425  cytochrome B561  43.35 
 
 		 201 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2065  cytochrome B561  45.32 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2105  cytochrome B561  44.83 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1964  cytochrome B561  44.33 
 
 		 201 aa  168  7e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156226  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0878  cytochrome B561  46.07 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0580408  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0148  cytochrome b561  44.67 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  33.17 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  33.17 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  34.96 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2713  cytochrome B561  29.63 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  33.49 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2186  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  34.87 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0690  cytochrome B561  28.16 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0677  cytochrome B561  27.88 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2233  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  34.36 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0108837  normal  0.187454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2399  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  34.36 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.356417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2286  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  34.36 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.08232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2240  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  34.36 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.728815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1527  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.52 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  hitchhiker  0.0000439849 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2383  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.19 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00487401  hitchhiker  0.000175861 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1961  cytochrome B561  28.91 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190116 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1751  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.91 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000335774  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1885  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.05 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1870  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.91 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.26404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01639  predicted cytochrome  28.44 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.467197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01629  hypothetical protein  28.44 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.5046  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1972  cytochrome B561  28.44 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0283  cytochrome B561  29.06 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  32.67 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  32.67 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.33 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2175  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.65 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000847396  normal  0.136379 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  34.83 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3373  Ni Fe-hydrogenase I large subunit-like protein  24.75 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1164  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  23 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  25.66 
 
 		 495 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3405  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.51 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.788903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50570  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit, HoxZ  24.44 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00896899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2149  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.73 
 
 		 261 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0320701  normal  0.217874 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3100  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.08 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  25.52 
 
 		 544 aa  42.4  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  23.61 
 
 		 212 aa  42  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0336  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.89 
 
 		 244 aa  41.6  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00129504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>