59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3141 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3141  cytochrome B561  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3634  cytochrome B561  52.66 
 
 		 208 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.430483  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0166  cytochrome B561  54.37 
 
 		 213 aa  229  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304607  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0377  cytochrome b561  54.55 
 
 		 199 aa  228  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1695  cytochrome B561  49.75 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3004  cytochrome B561  53.81 
 
 		 215 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0455486  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0091  cytochrome B561  47.42 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000871818 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0241  cytochrome B561  51.26 
 
 		 202 aa  205  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0540804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0878  cytochrome B561  51 
 
 		 197 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0580408  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1393  cytochrome B561  49.74 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2159  cytochrome B561  43.28 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.862051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2065  cytochrome B561  43.28 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2105  cytochrome B561  44.28 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0148  cytochrome b561  46.94 
 
 		 198 aa  179  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1198  hydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  42.79 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1964  cytochrome B561  41.79 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156226  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2425  cytochrome B561  40.3 
 
 		 201 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  34.12 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2713  cytochrome B561  32.29 
 
 		 222 aa  94.7  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  33.65 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2186  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  32 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  29.33 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  29.81 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0677  cytochrome B561  28.85 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0690  cytochrome B561  29.81 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204207 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2399  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  32 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.356417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2286  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  32 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.08232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2240  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  32 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.728815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2233  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  32 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0108837  normal  0.187454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2383  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.43 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00487401  hitchhiker  0.000175861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1527  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.47 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  hitchhiker  0.0000439849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1885  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.95 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01629  hypothetical protein  28.29 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.5046  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1972  cytochrome B561  28.29 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01639  predicted cytochrome  28.29 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.467197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1870  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.5 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.26404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1961  cytochrome B561  28.02 
 
 		 261 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190116 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1751  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.02 
 
 		 261 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000335774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0283  cytochrome B561  29 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3330  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.16 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.67 
 
 		 207 aa  48.5  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1367  cytochrome B561  26.37 
 
 		 390 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1164  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  23.38 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  24.27 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3770  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  24.46 
 
 		 244 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50570  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit, HoxZ  24.23 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00896899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0121  nickel-iron hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.11 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.347229  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  26.83 
 
 		 288 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  27.81 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  22.88 
 
 		 266 aa  42.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  28.95 
 
 		 280 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  23.03 
 
 		 269 aa  42.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0163  nickel-iron hydrogenase, small subunit  25.11 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.979082  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  26.26 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1156  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.08 
 
 		 242 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1276  cytochrome B561  25.93 
 
 		 225 aa  42  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1152  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.43 
 
 		 254 aa  41.6  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.955059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2916  cytochrome B561  24.88 
 
 		 390 aa  41.6  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.494489 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3100  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.67 
 
 		 248 aa  41.6  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>