47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2186 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2186  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  100 
 
 		 254 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2233  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  98.82 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0108837  normal  0.187454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2286  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  99.21 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.08232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2240  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  98.82 
 
 		 254 aa  507  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.728815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2399  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  98.43 
 
 		 254 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.356417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2383  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  57.44 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00487401  hitchhiker  0.000175861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1527  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  56.61 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  hitchhiker  0.0000439849 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1972  cytochrome B561  56.2 
 
 		 261 aa  238  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01629  hypothetical protein  56.2 
 
 		 261 aa  238  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.5046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01639  predicted cytochrome  56.2 
 
 		 261 aa  238  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.467197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1870  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  56.2 
 
 		 261 aa  238  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.26404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1961  cytochrome B561  55.79 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190116 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1885  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  56.2 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1751  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  55.79 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000335774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0283  cytochrome B561  52.3 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  35.21 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0377  cytochrome b561  36.17 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1695  cytochrome B561  34.95 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2425  cytochrome B561  34.18 
 
 		 201 aa  99  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1198  hydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  32.99 
 
 		 201 aa  98.6  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2159  cytochrome B561  33.84 
 
 		 201 aa  98.2  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.862051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3634  cytochrome B561  34.69 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.430483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  32.86 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1964  cytochrome B561  32.49 
 
 		 201 aa  96.7  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  31.63 
 
 		 221 aa  96.3  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0091  cytochrome B561  34.87 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000871818 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0241  cytochrome B561  35.2 
 
 		 202 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0540804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2065  cytochrome B561  31.31 
 
 		 201 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3141  cytochrome B561  32 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2105  cytochrome B561  31.31 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0166  cytochrome B561  32.04 
 
 		 213 aa  89.7  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304607  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  32.38 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3004  cytochrome B561  32.99 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0455486  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0148  cytochrome b561  31.75 
 
 		 198 aa  88.6  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0690  cytochrome B561  31.44 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0677  cytochrome B561  31.79 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2713  cytochrome B561  31.5 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0878  cytochrome B561  30 
 
 		 197 aa  72  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0580408  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1393  cytochrome B561  32.62 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1961  hypothetical protein  30.32 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1763  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.53 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.6 
 
 		 207 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08530  Ni,Fe-hydrogenase I cytochrome b subunit  26.09 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.360929 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  27.18 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3258  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.81 
 
 		 396 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.263075  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1173  formate dehydrogenase gamma subunit  27 
 
 		 388 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601281  normal  0.202143 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  28.85 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>