47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01639 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1972  cytochrome B561  100 
 
 		 261 aa  533  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01629  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  533  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.5046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01639  predicted cytochrome  100 
 
 		 261 aa  533  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.467197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1870  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  99.23 
 
 		 261 aa  531  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.26404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1961  cytochrome B561  98.85 
 
 		 261 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190116 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1751  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  98.85 
 
 		 261 aa  530  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000335774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2383  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  98.08 
 
 		 261 aa  523  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00487401  hitchhiker  0.000175861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1527  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  97.32 
 
 		 261 aa  495  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  hitchhiker  0.0000439849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1885  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  97.7 
 
 		 261 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0283  cytochrome B561  62.84 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2186  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  56.2 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2233  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  56.61 
 
 		 254 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0108837  normal  0.187454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2286  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  56.2 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.08232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2240  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  55.79 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.728815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2399  thiosulfate reductase cytochrome B subunit  55.79 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.356417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  35.44 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  32.37 
 
 		 218 aa  96.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1695  cytochrome B561  33.82 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  32.26 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3004  cytochrome B561  32.02 
 
 		 215 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0455486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  32.68 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1964  cytochrome B561  30.88 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156226  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1198  hydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  31.19 
 
 		 201 aa  89.4  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2065  cytochrome B561  28.86 
 
 		 201 aa  86.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2159  cytochrome B561  31.53 
 
 		 201 aa  86.3  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.862051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2713  cytochrome B561  31.03 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2425  cytochrome B561  30.69 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3141  cytochrome B561  28.29 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2105  cytochrome B561  28.86 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3634  cytochrome B561  29.44 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.430483  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0166  cytochrome B561  30.58 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.304607  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0091  cytochrome B561  32.02 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000871818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0377  cytochrome b561  28.71 
 
 		 199 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0241  cytochrome B561  32.18 
 
 		 202 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0540804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0148  cytochrome b561  28.57 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0677  cytochrome B561  31.25 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0690  cytochrome B561  30.89 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0878  cytochrome B561  30.88 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0580408  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1393  cytochrome B561  33.51 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1961  hypothetical protein  34.17 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08530  Ni,Fe-hydrogenase I cytochrome b subunit  26.37 
 
 		 229 aa  47.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.360929 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0938  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  25.81 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2451  formate dehydrogenase gamma subunit  26.67 
 
 		 339 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779662  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2027  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.43 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5280  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.33 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  34.83 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0163  nickel-iron hydrogenase, small subunit  26.75 
 
 		 228 aa  42.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.979082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>