81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4105 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  100 
 
 
270 aa  555  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  73.61 
 
 
269 aa  424  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  74.16 
 
 
266 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  46.52 
 
 
288 aa  224  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  45.52 
 
 
280 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  43.01 
 
 
280 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  44.85 
 
 
287 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  43.7 
 
 
299 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  43.68 
 
 
285 aa  195  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  45.09 
 
 
280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  42.42 
 
 
280 aa  189  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  42.91 
 
 
290 aa  178  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  42.54 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  43.66 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  34.93 
 
 
287 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  31.11 
 
 
242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  31.32 
 
 
229 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  30.38 
 
 
242 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  32.2 
 
 
265 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  29.66 
 
 
495 aa  92.8  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.8 
 
 
517 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  26.85 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  25.97 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  35.16 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  34.65 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  34.27 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  28.99 
 
 
216 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  29.14 
 
 
207 aa  62.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  32.37 
 
 
217 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  25.32 
 
 
213 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  33.8 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  31.5 
 
 
378 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  31.5 
 
 
366 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  31.5 
 
 
366 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  30.66 
 
 
202 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  31.5 
 
 
361 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  31.5 
 
 
378 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  33.59 
 
 
210 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  33.59 
 
 
210 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  33.59 
 
 
210 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  33.59 
 
 
210 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  30.71 
 
 
208 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  30.71 
 
 
374 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  33.57 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  30.71 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  34.93 
 
 
201 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  25.61 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  32.81 
 
 
210 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  30.71 
 
 
373 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  31.25 
 
 
210 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  31.5 
 
 
210 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  31.68 
 
 
201 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  33.07 
 
 
224 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  30.71 
 
 
201 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  28.31 
 
 
219 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  33.07 
 
 
217 aa  52.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  30.77 
 
 
210 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  33.07 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  26.01 
 
 
245 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  29.52 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4165  hypothetical protein  24.7 
 
 
198 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  28.87 
 
 
209 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2713  cytochrome B561  33.33 
 
 
222 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  29.41 
 
 
210 aa  49.3  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  25.71 
 
 
218 aa  48.9  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2748  hypothetical protein  32.93 
 
 
366 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308012  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2130  cytochrome B561  26.4 
 
 
390 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.578698  normal  0.698297 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  27.94 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  30.47 
 
 
198 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0804  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0938  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  24.57 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2105  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.07 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  29.6 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  32.79 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  32.79 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  29.51 
 
 
212 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0052  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.05 
 
 
231 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.036623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0690  cytochrome B561  22.87 
 
 
244 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204207 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2827  formate dehydrogenase, gamma subunit  62.16 
 
 
228 aa  42.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.501112  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1039  hypothetical protein  27.66 
 
 
492 aa  42.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0863  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  24.14 
 
 
221 aa  42  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.627078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>