40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0804 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0804  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  487  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1941  (Ni/Fe) hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29.41 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1998  Ni/Fe-hydrogenase, 1 b-type cytochrome subunit  24.88 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1860  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.94 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.51 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  25 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50570  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit, HoxZ  22.59 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00896899  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1156  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.75 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0857  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.94 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2130  cytochrome B561  24.88 
 
 		 390 aa  47  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.578698  normal  0.698297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0870  formate dehydrogenase gamma subunit  23.04 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0974  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.94 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000584739  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1164  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  23.74 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  25 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3770  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  23.74 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1163  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  24.12 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1972  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  21.97 
 
 		 246 aa  45.1  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.184335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  22.32 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1763  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.56 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2027  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.89 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0506  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.05 
 
 		 342 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.579311 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  26.28 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3100  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.96 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1483  formate dehydrogenase, cytochrome B subunit  28.27 
 
 		 317 aa  43.1  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.942995  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1591  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.45 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  26.45 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3987  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  24.62 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1367  cytochrome B561  23 
 
 		 390 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2916  cytochrome B561  24.07 
 
 		 390 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.494489 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1208  formate dehydrogenase, gamma subunit, putative  24.44 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.37 
 
 		 491 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1277  cytochrome B561  23.85 
 
 		 232 aa  42  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.258136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1295  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  21.86 
 
 		 243 aa  42  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00118042  normal  0.526274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  24.17 
 
 		 221 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0855  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.5 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.34705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3488  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.12 
 
 		 208 aa  41.6  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1649  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  22.77 
 
 		 247 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1708  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  22.77 
 
 		 247 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.33968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1634  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  22.77 
 
 		 247 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1799  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  22.77 
 
 		 247 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>