25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1941 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1941  (Ni/Fe) hydrogenase, b-type cytochrome subunit  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0804  hypothetical protein  29.41 
 
 		 238 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.89 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  28.7 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  28.11 
 
 		 242 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  24.32 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  30.32 
 
 		 757 aa  48.9  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0855  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  31.15 
 
 		 229 aa  48.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.34705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  29.03 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3146  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.75 
 
 		 258 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0114554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  27.14 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  26.78 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2321  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.15 
 
 		 258 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08530  Ni,Fe-hydrogenase I cytochrome b subunit  24.14 
 
 		 229 aa  45.1  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.360929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3405  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.75 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.788903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0690  cytochrome B561  24.35 
 
 		 244 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0677  cytochrome B561  23.32 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  25.12 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1434  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  25.24 
 
 		 243 aa  42.4  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.237376  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  27.67 
 
 		 288 aa  42  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  25.68 
 
 		 218 aa  42  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1591  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.78 
 
 		 229 aa  41.6  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2713  cytochrome B561  26.15 
 
 		 222 aa  41.2  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3089  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.36 
 
 		 339 aa  41.2  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971342  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  26.17 
 
 		 227 aa  40.8  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>