101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3633 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  100 
 
 		 290 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  98.28 
 
 		 290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  92.73 
 
 		 290 aa  484  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  67.83 
 
 		 287 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  55.47 
 
 		 280 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  56.27 
 
 		 280 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  52.73 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  49.46 
 
 		 280 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  47.74 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  46.97 
 
 		 280 aa  208  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  44.44 
 
 		 269 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  43.51 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  43.63 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  42.54 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  41.51 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  41.25 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  39.56 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  36.64 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  36.47 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.4 
 
 		 517 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  28.14 
 
 		 495 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  33.2 
 
 		 210 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  30.04 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  30.8 
 
 		 216 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  37.76 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  28.85 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  39.6 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4165  hypothetical protein  29.1 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  40.28 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  27.44 
 
 		 366 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  27.44 
 
 		 366 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  27.44 
 
 		 361 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  27.44 
 
 		 378 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  27.44 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  41.79 
 
 		 198 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  31.06 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  28.74 
 
 		 227 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  28 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  27.38 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  28.99 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  27.07 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  35.19 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  37.23 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  28.8 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  27.78 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  27.07 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  36.36 
 
 		 214 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  26.98 
 
 		 212 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  34.27 
 
 		 544 aa  75.1  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  29.54 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  36.05 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  36.05 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  32 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  36.36 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  35.86 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  35.66 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  37.24 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2748  hypothetical protein  30 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308012  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  36.36 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1039  hypothetical protein  34.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  29.6 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  29.82 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  37.69 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  28.18 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  29.14 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  26.58 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  32.11 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4931  hypothetical protein  28.19 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2841  hypothetical protein  24.9 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1751  hypothetical protein  28.19 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172426  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64550  hypothetical protein  31.36 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  27.09 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  26.58 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  26.16 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  25.5 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5605  hypothetical protein  30.91 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2159  cytochrome B561  29.56 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.862051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1964  cytochrome B561  30.13 
 
 		 201 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2470  hypothetical protein  31.33 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000036343 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1202  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  26.4 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2729  hypothetical protein  27 
 
 		 199 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.95 
 
 		 207 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0542  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit oxidoreductase protein  32.58 
 
 		 210 aa  52.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0959  hypothetical protein  26.52 
 
 		 199 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3004  cytochrome B561  34.34 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0455486  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2425  cytochrome B561  25.64 
 
 		 201 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  30.85 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0677  cytochrome B561  27.74 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1277  cytochrome B561  30.36 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.258136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2713  cytochrome B561  27.63 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0690  cytochrome B561  27.74 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204207 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2105  cytochrome B561  28.93 
 
 		 201 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2065  cytochrome B561  29.03 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2031  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.53 
 
 		 222 aa  46.2  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.172243  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  32.98 
 
 		 221 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  26.09 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  24.31 
 
 		 218 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1198  hydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  27.74 
 
 		 201 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2105  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.78 
 
 		 222 aa  42.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1906  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.78 
 
 		 221 aa  42.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142953 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>