84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2312 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  400  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  95.57 
 
 
216 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  80.92 
 
 
219 aa  197  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  40.76 
 
 
217 aa  122  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  44.94 
 
 
210 aa  121  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  42.04 
 
 
209 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  44.81 
 
 
207 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  41.88 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  40.76 
 
 
212 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  41.55 
 
 
245 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  43.75 
 
 
206 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  42.76 
 
 
198 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  42.11 
 
 
212 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  41.29 
 
 
210 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  42.11 
 
 
210 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  41.4 
 
 
213 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  42.25 
 
 
210 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  40.13 
 
 
210 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  40.13 
 
 
210 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  41.03 
 
 
361 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  41.03 
 
 
366 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  41.03 
 
 
378 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  41.03 
 
 
366 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  41.03 
 
 
378 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  42.11 
 
 
210 aa  97.8  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  41.56 
 
 
374 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  39.49 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  38.85 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  40.13 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0542  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit oxidoreductase protein  43.18 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  42.35 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  40.38 
 
 
373 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  38.61 
 
 
203 aa  95.1  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4931  hypothetical protein  44.1 
 
 
211 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  37.59 
 
 
214 aa  94.4  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1751  hypothetical protein  44.52 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172426  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  33.99 
 
 
201 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  39.57 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  40.13 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  39.13 
 
 
201 aa  92  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  42.21 
 
 
222 aa  91.7  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  40.97 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2841  hypothetical protein  43.12 
 
 
336 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2729  hypothetical protein  42.21 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4165  hypothetical protein  35.51 
 
 
198 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  42.58 
 
 
224 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  38.13 
 
 
223 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  41.72 
 
 
224 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  37.16 
 
 
227 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  38 
 
 
225 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  34.51 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  40.24 
 
 
198 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  36.43 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64550  hypothetical protein  49.19 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1202  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  38.16 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0959  hypothetical protein  28.68 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309529  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5605  hypothetical protein  48.39 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  36.62 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  32.1 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  34.04 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  35 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  37.82 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  34.62 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  35.06 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  35.77 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  35.53 
 
 
229 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  30.66 
 
 
270 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.4 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  29.37 
 
 
495 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  36.44 
 
 
290 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  36.44 
 
 
290 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2295  hypothetical protein  32.52 
 
 
208 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  34.29 
 
 
280 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  33.58 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  33.58 
 
 
266 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.7 
 
 
517 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  33.88 
 
 
290 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  24.1 
 
 
287 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2321  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.48 
 
 
258 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2130  cytochrome B561  26.88 
 
 
390 aa  42  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.578698  normal  0.698297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3369  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.81 
 
 
240 aa  41.6  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00901378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  30.67 
 
 
224 aa  41.2  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>