103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0962 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  55.05 
 
 		 209 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  52.55 
 
 		 213 aa  208  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  53.73 
 
 		 209 aa  204  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  53.37 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  52.28 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  50.77 
 
 		 212 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  55.5 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  52.33 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  51 
 
 		 374 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  52.85 
 
 		 210 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  52.5 
 
 		 210 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  52.5 
 
 		 210 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  49.76 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  53.4 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  50.5 
 
 		 361 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  50.5 
 
 		 378 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  50.5 
 
 		 366 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  50.5 
 
 		 378 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  50.5 
 
 		 366 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  50.94 
 
 		 225 aa  194  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  52.79 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  50 
 
 		 373 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  48.76 
 
 		 210 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  51.26 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  48.91 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  47.21 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  54.31 
 
 		 209 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  47.26 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  48.6 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  48.13 
 
 		 224 aa  181  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  50.79 
 
 		 212 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2841  hypothetical protein  49.5 
 
 		 336 aa  178  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1202  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  50.79 
 
 		 214 aa  178  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  46.97 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  44.78 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  45.96 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  47.91 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  48.77 
 
 		 207 aa  175  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  47.17 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2729  hypothetical protein  50.26 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1751  hypothetical protein  52.36 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172426  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4931  hypothetical protein  52.02 
 
 		 211 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0542  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit oxidoreductase protein  49.21 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  46.19 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  48.95 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  49.26 
 
 		 206 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  45.45 
 
 		 201 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64550  hypothetical protein  48.52 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5605  hypothetical protein  47.93 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  37.62 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4165  hypothetical protein  34.18 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  30.38 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  42.21 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  32.13 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  31.12 
 
 		 242 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  30.93 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0959  hypothetical protein  29.84 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  28.85 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  36.28 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  28.09 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  34.18 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  29.07 
 
 		 280 aa  72  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  25.19 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  28.2 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  27.03 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2295  hypothetical protein  31.87 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  25.86 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  31.82 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  26.39 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  36.5 
 
 		 495 aa  58.5  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  32.03 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  28.7 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.89 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0677  cytochrome B561  23.9 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  28.7 
 
 		 290 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.35 
 
 		 517 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  26.46 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  26.52 
 
 		 290 aa  52  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  23.81 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1277  cytochrome B561  26.5 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.258136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2130  cytochrome B561  26.85 
 
 		 390 aa  50.1  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.578698  normal  0.698297 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0690  cytochrome B561  23.41 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204207 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  30.38 
 
 		 269 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  33.33 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3369  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.74 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00901378  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2027  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.87 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  25.78 
 
 		 270 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2713  cytochrome B561  24.08 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  22.11 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  26.6 
 
 		 544 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08530  Ni,Fe-hydrogenase I cytochrome b subunit  25.37 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.360929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  30.51 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3908  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  20.9 
 
 		 253 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1972  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.7 
 
 		 246 aa  42.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.184335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3373  Ni Fe-hydrogenase I large subunit-like protein  23.77 
 
 		 263 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1208  formate dehydrogenase, gamma subunit, putative  25.45 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 		 435 aa  42.4  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0543  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.75 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1367  cytochrome B561  23.68 
 
 		 390 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>