99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1696 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  424  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  83.67 
 
 		 207 aa  332  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  54.11 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  56 
 
 		 209 aa  214  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1751  hypothetical protein  61.98 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172426  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  54.25 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  54.21 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  57.89 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4931  hypothetical protein  62.16 
 
 		 211 aa  207  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  56.63 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  58.28 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  56.19 
 
 		 214 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  57.22 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  54.36 
 
 		 209 aa  191  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  51.02 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  53.23 
 
 		 201 aa  181  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  55.91 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  50 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  49.73 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64550  hypothetical protein  59.49 
 
 		 204 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  48.95 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  49.49 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  50 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  50 
 
 		 366 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  50 
 
 		 378 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  52.69 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  50 
 
 		 366 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  50 
 
 		 378 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  50.5 
 
 		 212 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  50.54 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  50 
 
 		 361 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  50 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  49.5 
 
 		 374 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  50.53 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  50.53 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  49.5 
 
 		 373 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5605  hypothetical protein  58.86 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  48.22 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  48.6 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  46.32 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  47.21 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2841  hypothetical protein  49.24 
 
 		 336 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  44.39 
 
 		 208 aa  168  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  48.13 
 
 		 198 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  48.92 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1202  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  48.53 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  46.77 
 
 		 203 aa  161  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0542  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit oxidoreductase protein  48.39 
 
 		 210 aa  154  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  49.2 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2729  hypothetical protein  46.77 
 
 		 199 aa  141  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  43.66 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  40.76 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4165  hypothetical protein  36.46 
 
 		 198 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  41.51 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  30.04 
 
 		 280 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  30.52 
 
 		 280 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0959  hypothetical protein  33.52 
 
 		 199 aa  91.3  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  31.64 
 
 		 288 aa  90.9  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  35.27 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  35.27 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  35.71 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  31.27 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  29.1 
 
 		 285 aa  78.2  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  30.65 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  32.87 
 
 		 287 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  28.88 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2295  hypothetical protein  32.37 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  31.2 
 
 		 299 aa  71.6  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  28.39 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  35.37 
 
 		 269 aa  68.2  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  35.37 
 
 		 266 aa  68.2  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  32.37 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  28.96 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  37.04 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  26.48 
 
 		 290 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  27.04 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1277  cytochrome B561  28.87 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.258136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.63 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1887  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1920  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  23.12 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1913  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  29 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.400664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.74 
 
 		 517 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2406  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.5 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0991035  hitchhiker  0.000275557 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7263  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.8 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73881  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  29.37 
 
 		 544 aa  48.1  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2157  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.5 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71471  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1878  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.5 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2090  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.427939  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1820  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.5 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  25.65 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  27.92 
 
 		 495 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0052  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.82 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.036623  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2097  quinone-reactive Ni/Fe hydrogenase, cytochrome b subunit  27 
 
 		 224 aa  45.1  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  25.13 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2105  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.46 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  26.52 
 
 		 287 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08530  Ni,Fe-hydrogenase I cytochrome b subunit  25.59 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.360929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  30.15 
 
 		 757 aa  42.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>