88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5019 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  100 
 
 		 212 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  76.42 
 
 		 213 aa  328  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  71.86 
 
 		 208 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  65.09 
 
 		 210 aa  280  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  65.05 
 
 		 210 aa  279  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  66.04 
 
 		 210 aa  278  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  67.48 
 
 		 210 aa  274  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  65.73 
 
 		 210 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  65.73 
 
 		 210 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  67.71 
 
 		 374 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  67.19 
 
 		 378 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  67.19 
 
 		 378 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  67.19 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  67.19 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  67.19 
 
 		 361 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  63.68 
 
 		 210 aa  269  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  66.67 
 
 		 373 aa  267  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  67.19 
 
 		 201 aa  261  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  64.29 
 
 		 198 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  64.88 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  64.62 
 
 		 217 aa  256  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  67.71 
 
 		 198 aa  250  9.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2841  hypothetical protein  65.82 
 
 		 336 aa  249  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  64.88 
 
 		 224 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  64 
 
 		 212 aa  245  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  63.11 
 
 		 203 aa  243  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0542  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit oxidoreductase protein  65.02 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  64 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2729  hypothetical protein  67.71 
 
 		 199 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  55.02 
 
 		 209 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1202  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  58.94 
 
 		 214 aa  222  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  53.85 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  57.29 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  50.77 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  54.69 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  54.17 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  52.83 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  47.21 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1751  hypothetical protein  54.69 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172426  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  49.48 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4931  hypothetical protein  54.17 
 
 		 211 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  50.23 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  46.19 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  49.25 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  48.21 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  45.27 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  47.7 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  44.28 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64550  hypothetical protein  51.25 
 
 		 204 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5605  hypothetical protein  52.5 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  39.15 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  40.76 
 
 		 202 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  38.86 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  35.35 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  36.62 
 
 		 242 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  36.53 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4165  hypothetical protein  35.26 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0959  hypothetical protein  33.7 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  28.52 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  31.53 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  27.27 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  29.6 
 
 		 287 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  27.74 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  31.17 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  35.67 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  27.2 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2748  hypothetical protein  31.92 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308012  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  32.68 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  32.68 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.71 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  27.46 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  30.71 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  26.82 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2295  hypothetical protein  31.07 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  25.82 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.82 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.61 
 
 		 495 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  30.53 
 
 		 544 aa  53.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  26.36 
 
 		 290 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  31.79 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  22.92 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1277  cytochrome B561  25.25 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.258136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  24.21 
 
 		 221 aa  45.1  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  23.98 
 
 		 290 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2470  hypothetical protein  28.14 
 
 		 310 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000036343 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1901  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  29.47 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  24.88 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  23.56 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>