90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2591 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  100 
 
 		 198 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  77.27 
 
 		 201 aa  320  8e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  68.53 
 
 		 210 aa  274  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  65.99 
 
 		 213 aa  266  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  69.39 
 
 		 203 aa  264  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  67.71 
 
 		 212 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  69.23 
 
 		 224 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0542  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit oxidoreductase protein  71.43 
 
 		 210 aa  257  8e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  65.48 
 
 		 208 aa  256  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  67.86 
 
 		 217 aa  254  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  69.23 
 
 		 224 aa  251  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2729  hypothetical protein  69.7 
 
 		 199 aa  249  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  65.1 
 
 		 210 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  64.06 
 
 		 210 aa  247  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  63.54 
 
 		 210 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  63.54 
 
 		 210 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  63.02 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  60.42 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  58.79 
 
 		 198 aa  238  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1202  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  67.35 
 
 		 214 aa  237  6.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  62.3 
 
 		 374 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  61.78 
 
 		 366 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  61.78 
 
 		 378 aa  234  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  61.78 
 
 		 366 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  61.78 
 
 		 378 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  61.78 
 
 		 361 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  59.28 
 
 		 212 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  61.26 
 
 		 373 aa  231  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  56.02 
 
 		 209 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2841  hypothetical protein  59.69 
 
 		 336 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  57.59 
 
 		 223 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  53.4 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  53.3 
 
 		 209 aa  186  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  46.97 
 
 		 222 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  51.56 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  51.05 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1751  hypothetical protein  56.77 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172426  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  50 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4931  hypothetical protein  55.33 
 
 		 211 aa  181  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  48.92 
 
 		 217 aa  175  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  48.73 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  52.06 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  47.85 
 
 		 207 aa  167  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  45.24 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  49.24 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  52.02 
 
 		 206 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  49.49 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  42.86 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64550  hypothetical protein  50 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5605  hypothetical protein  49.09 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  37.62 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  40.58 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  40.24 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  36.77 
 
 		 229 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  31.96 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  34.01 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  34.26 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4165  hypothetical protein  32 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  26.95 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  29.6 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  28.06 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  27.55 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.91 
 
 		 517 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  27.63 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  29.87 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.19 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  36.97 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  26.25 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2295  hypothetical protein  31.03 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  27.4 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  26.77 
 
 		 280 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  31.5 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  26.91 
 
 		 495 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  26.48 
 
 		 290 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  25.32 
 
 		 269 aa  48.9  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  25.32 
 
 		 266 aa  48.9  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  23.35 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1448  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.87 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0615119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3369  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.17 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00901378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  27.05 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  24.55 
 
 		 290 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0857  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.28 
 
 		 227 aa  45.1  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  24.61 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  28 
 
 		 544 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2713  cytochrome B561  27.14 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1277  cytochrome B561  23.96 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.258136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  25.38 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0690  cytochrome B561  26.7 
 
 		 244 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  21.69 
 
 		 221 aa  42  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>