94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3942 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  535  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  44.59 
 
 
242 aa  195  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  44.59 
 
 
229 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  42 
 
 
242 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  35.85 
 
 
280 aa  159  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  35.96 
 
 
288 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  35.83 
 
 
280 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  33.71 
 
 
280 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  32.26 
 
 
280 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  35.04 
 
 
287 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  33.2 
 
 
299 aa  115  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  28.52 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  33.05 
 
 
495 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  37.25 
 
 
290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  32.96 
 
 
269 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  32.96 
 
 
266 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  36.47 
 
 
290 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  36.08 
 
 
290 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  32.2 
 
 
270 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.32 
 
 
517 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  32.39 
 
 
366 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  32.39 
 
 
366 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  32.39 
 
 
378 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  32.39 
 
 
361 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  31.98 
 
 
378 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  31.98 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  28.88 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  31.43 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  31.17 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  28.63 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  31.54 
 
 
210 aa  82  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  26.46 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  29.28 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  29.41 
 
 
208 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  34.23 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  30.86 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  29.82 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  30.94 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  31.22 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2841  hypothetical protein  30.22 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  32.48 
 
 
227 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  29.13 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  29.69 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  29.13 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  35.42 
 
 
544 aa  73.6  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  28.76 
 
 
217 aa  72  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  28.76 
 
 
210 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  30.04 
 
 
201 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  27.6 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  27.9 
 
 
210 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  29.36 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  28.76 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  27.54 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  28.25 
 
 
198 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  29.82 
 
 
203 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  31.42 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1202  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  26.92 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  25.82 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  29.33 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2748  hypothetical protein  32.14 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  31.77 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  28.19 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3908  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  28.1 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  30.73 
 
 
206 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1039  hypothetical protein  33.33 
 
 
492 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0542  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit oxidoreductase protein  30.22 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  25.82 
 
 
224 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  27.83 
 
 
223 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  28.32 
 
 
201 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4931  hypothetical protein  30.07 
 
 
211 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1751  hypothetical protein  29.37 
 
 
210 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172426  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2729  hypothetical protein  27.43 
 
 
199 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.47 
 
 
207 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  32.03 
 
 
222 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  27.31 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2470  hypothetical protein  30.63 
 
 
310 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000036343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64550  hypothetical protein  29.32 
 
 
204 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5605  hypothetical protein  29.32 
 
 
204 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2031  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.7 
 
 
222 aa  46.2  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.172243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2713  cytochrome B561  24.64 
 
 
222 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0690  cytochrome B561  24.66 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0677  cytochrome B561  25.11 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1208  formate dehydrogenase, gamma subunit, putative  24.03 
 
 
211 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1367  cytochrome B561  24.56 
 
 
390 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2929  cytochrome B561  19.62 
 
 
224 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129644  decreased coverage  1.11241e-17 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2105  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.32 
 
 
222 aa  42.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03830  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.67 
 
 
215 aa  42.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2916  cytochrome B561  24.67 
 
 
390 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.494489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  29.13 
 
 
214 aa  42  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2157  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.58 
 
 
224 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71471  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1878  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  22.58 
 
 
224 aa  42  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>