34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2470 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2470  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000036343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2748  hypothetical protein  80.65 
 
 
366 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308012  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1039  hypothetical protein  57.19 
 
 
492 aa  317  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  58.84 
 
 
544 aa  316  3e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.55 
 
 
517 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.84 
 
 
495 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  28.21 
 
 
242 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  26.92 
 
 
242 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  31.61 
 
 
280 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  31.39 
 
 
280 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  31.43 
 
 
265 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  28.67 
 
 
229 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  29.58 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  27.07 
 
 
288 aa  53.5  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  30.53 
 
 
209 aa  52.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  34.21 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  38.2 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  38.2 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  29.52 
 
 
280 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  26.45 
 
 
245 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  34.83 
 
 
270 aa  49.7  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  28.65 
 
 
209 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  26.35 
 
 
287 aa  45.8  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  29.06 
 
 
217 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  28.51 
 
 
213 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  30.7 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  27.94 
 
 
210 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  28.02 
 
 
210 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  28.02 
 
 
210 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  26.84 
 
 
214 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  29.2 
 
 
290 aa  42.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  28.06 
 
 
210 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  28.02 
 
 
210 aa  42.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>