More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0157 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0157  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
321 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.337145 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2142  putative sulfite oxidase subunit YedY  68.39 
 
 
330 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0560  putative sulfite oxidase subunit YedY  65 
 
 
317 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0505928  normal  0.0124744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5829  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.23 
 
 
324 aa  408  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0197  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.17 
 
 
322 aa  408  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359289  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2734  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.19 
 
 
321 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.49 
 
 
319 aa  324  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2658  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.35 
 
 
311 aa  316  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708237  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2723  putative sulfite oxidase subunit YedY  50 
 
 
325 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2134  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.96 
 
 
302 aa  305  7e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.78 
 
 
337 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  50.78 
 
 
337 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1758  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.59 
 
 
325 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3750  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.73 
 
 
326 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.677128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0060  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.72 
 
 
330 aa  300  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.23 
 
 
328 aa  298  7e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3696  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.04 
 
 
326 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.31 
 
 
341 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2049  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.81 
 
 
315 aa  295  9e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00190211  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.31 
 
 
337 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.61 
 
 
337 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.16 
 
 
319 aa  292  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.53 
 
 
337 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.16 
 
 
319 aa  292  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.31 
 
 
337 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.59 
 
 
313 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1981  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.66 
 
 
340 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141842  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.48 
 
 
319 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.44 
 
 
313 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  50 
 
 
336 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0627  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.17 
 
 
322 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000395521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2717  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.79 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.18 
 
 
333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.02 
 
 
298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.79 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5406  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.42 
 
 
337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1017  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.2 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.6 
 
 
344 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.04 
 
 
315 aa  281  8.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.14 
 
 
313 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.04 
 
 
315 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.04 
 
 
315 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.29 
 
 
302 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62110  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.42 
 
 
337 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2527  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.24 
 
 
345 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.04 
 
 
311 aa  279  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.58 
 
 
333 aa  279  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1893  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.4 
 
 
334 aa  279  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.772909  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.69 
 
 
340 aa  279  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.99 
 
 
366 aa  278  6e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.38 
 
 
331 aa  278  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.01 
 
 
344 aa  278  7e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.38 
 
 
332 aa  278  8e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.27 
 
 
366 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.68 
 
 
366 aa  277  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.41 
 
 
344 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.55 
 
 
318 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0877  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.16 
 
 
322 aa  276  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.687916  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.16 
 
 
333 aa  276  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.18 
 
 
316 aa  275  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3633  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.06 
 
 
338 aa  275  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3877  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.26 
 
 
306 aa  275  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.41 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.73 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.48 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.68 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.48 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.48 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.48 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.48 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0886  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.27 
 
 
324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00104567  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.3 
 
 
334 aa  272  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  47.68 
 
 
334 aa  272  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.68 
 
 
334 aa  272  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  47.68 
 
 
334 aa  272  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0576  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.7 
 
 
341 aa  272  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.11 
 
 
344 aa  271  7e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.68 
 
 
334 aa  272  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.68 
 
 
334 aa  271  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3675  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.99 
 
 
334 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0647126  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.68 
 
 
334 aa  271  7e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3640  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.99 
 
 
334 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000496426 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.35 
 
 
320 aa  271  9e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.99 
 
 
334 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3737  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.99 
 
 
334 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  0.0204641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3569  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.68 
 
 
334 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0584327  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3568  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.68 
 
 
334 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00040411  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0371  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.91 
 
 
320 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.789292 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2345  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.11 
 
 
347 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3690  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.84 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2855  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.9 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.71 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01069  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.55 
 
 
335 aa  269  4e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.75 
 
 
333 aa  269  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.06 
 
 
331 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3992  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.5 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.74 
 
 
331 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.51 
 
 
338 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.39 
 
 
331 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.45 
 
 
331 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>