More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2142 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2142  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
330 aa  676    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0157  putative sulfite oxidase subunit YedY  68.39 
 
 
321 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.337145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0560  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.55 
 
 
317 aa  424  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0505928  normal  0.0124744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5829  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.42 
 
 
324 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0197  putative sulfite oxidase subunit YedY  63.33 
 
 
322 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359289  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2734  putative sulfite oxidase subunit YedY  58.36 
 
 
321 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2723  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.38 
 
 
325 aa  320  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1758  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.48 
 
 
325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0627  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.3 
 
 
322 aa  299  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000395521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0060  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.56 
 
 
330 aa  293  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2134  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.83 
 
 
302 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.57 
 
 
319 aa  292  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2527  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.2 
 
 
345 aa  291  9e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1893  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.77 
 
 
334 aa  291  9e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.772909  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.45 
 
 
333 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2658  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.73 
 
 
311 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708237  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2049  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.56 
 
 
315 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00190211  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2345  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.18 
 
 
347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.99 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  46.95 
 
 
337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3696  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.2 
 
 
326 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.15 
 
 
344 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.15 
 
 
344 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3750  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.2 
 
 
326 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.677128 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.76 
 
 
313 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.56 
 
 
344 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.15 
 
 
344 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.15 
 
 
344 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.15 
 
 
344 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  45 
 
 
337 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.69 
 
 
302 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.18 
 
 
328 aa  280  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.85 
 
 
337 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.45 
 
 
313 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.15 
 
 
333 aa  279  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.9 
 
 
313 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.56 
 
 
333 aa  278  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.02 
 
 
298 aa  279  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0576  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.91 
 
 
341 aa  278  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.7 
 
 
341 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2717  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.62 
 
 
327 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.36 
 
 
338 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.27 
 
 
344 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.4 
 
 
336 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.86 
 
 
344 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1981  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.47 
 
 
340 aa  276  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141842  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5406  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.6 
 
 
337 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.7 
 
 
337 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.56 
 
 
344 aa  275  9e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.65 
 
 
337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3877  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.33 
 
 
306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0371  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.99 
 
 
320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.789292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62110  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.18 
 
 
337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944415 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.56 
 
 
366 aa  273  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.79 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.26 
 
 
366 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.26 
 
 
366 aa  271  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3737  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.48 
 
 
334 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  0.0204641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3640  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.48 
 
 
334 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000496426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3675  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.48 
 
 
334 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0647126  normal  0.489877 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  47.45 
 
 
334 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3568  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.17 
 
 
334 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00040411  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.97 
 
 
344 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.45 
 
 
334 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.45 
 
 
334 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  47.45 
 
 
334 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3569  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.17 
 
 
334 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0584327  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.45 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.45 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.45 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.57 
 
 
331 aa  269  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.87 
 
 
334 aa  269  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.43 
 
 
332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.68 
 
 
317 aa  268  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.17 
 
 
331 aa  268  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.15 
 
 
334 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1462  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.64 
 
 
328 aa  267  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00391341  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.81 
 
 
333 aa  266  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.18 
 
 
331 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.71 
 
 
331 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2123  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.59 
 
 
336 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3690  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.71 
 
 
333 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.32 
 
 
331 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.88 
 
 
331 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.81 
 
 
310 aa  265  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.87 
 
 
331 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.87 
 
 
331 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.87 
 
 
331 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.87 
 
 
331 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.87 
 
 
331 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.87 
 
 
331 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.65 
 
 
340 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.31 
 
 
331 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.1 
 
 
331 aa  263  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.31 
 
 
344 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.92 
 
 
331 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1017  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.54 
 
 
317 aa  263  4e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.79 
 
 
331 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1578  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.37 
 
 
297 aa  261  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.1 
 
 
319 aa  260  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>