More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2723 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2723  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
325 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0627  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.38 
 
 
322 aa  448  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000395521  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0157  putative sulfite oxidase subunit YedY  50 
 
 
321 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.337145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0560  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.97 
 
 
317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0505928  normal  0.0124744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2142  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.61 
 
 
330 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5829  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.16 
 
 
324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0197  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.87 
 
 
322 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359289  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2734  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.31 
 
 
321 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3750  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.67 
 
 
326 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.677128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2717  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.52 
 
 
327 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0060  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.54 
 
 
330 aa  294  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3696  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.03 
 
 
326 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.6 
 
 
319 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.6 
 
 
319 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1758  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.15 
 
 
325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2049  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.62 
 
 
315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00190211  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2527  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.55 
 
 
345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1893  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.93 
 
 
334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.772909  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.71 
 
 
331 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1981  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.35 
 
 
340 aa  279  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141842  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.31 
 
 
319 aa  279  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2134  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.37 
 
 
302 aa  276  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.28 
 
 
336 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.37 
 
 
334 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.59 
 
 
331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.35 
 
 
313 aa  271  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.31 
 
 
344 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.44 
 
 
331 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.44 
 
 
331 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.44 
 
 
331 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.44 
 
 
331 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.44 
 
 
331 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.68 
 
 
311 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.51 
 
 
331 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.73 
 
 
319 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1017  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.14 
 
 
317 aa  271  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2658  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.08 
 
 
311 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708237  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.31 
 
 
344 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.27 
 
 
331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.65 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.57 
 
 
340 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2345  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.32 
 
 
347 aa  269  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.31 
 
 
344 aa  269  5e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0886  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.83 
 
 
324 aa  269  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00104567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.88 
 
 
338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.45 
 
 
315 aa  268  8e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.37 
 
 
310 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.41 
 
 
331 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0576  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.31 
 
 
341 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.39 
 
 
366 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.41 
 
 
331 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2912  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.56 
 
 
331 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.57 
 
 
315 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.79 
 
 
344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.08 
 
 
366 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.08 
 
 
366 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.62 
 
 
344 aa  265  8e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.89 
 
 
337 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.76 
 
 
315 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.89 
 
 
316 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01069  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.65 
 
 
335 aa  263  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.31 
 
 
331 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2123  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.89 
 
 
336 aa  263  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.39 
 
 
333 aa  263  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.06 
 
 
341 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.63 
 
 
313 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.66 
 
 
331 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.57 
 
 
337 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.28 
 
 
331 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.28 
 
 
331 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.57 
 
 
337 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.28 
 
 
331 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.76 
 
 
302 aa  259  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.81 
 
 
331 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.37 
 
 
313 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.27 
 
 
336 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.08 
 
 
344 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.28 
 
 
331 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.08 
 
 
344 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.08 
 
 
344 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.08 
 
 
344 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.16 
 
 
317 aa  258  9e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.4 
 
 
298 aa  258  9e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0428  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.63 
 
 
297 aa  258  1e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0877  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.19 
 
 
322 aa  257  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.687916  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.22 
 
 
331 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.85 
 
 
333 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.89 
 
 
331 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.91 
 
 
313 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  42.09 
 
 
315 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.89 
 
 
344 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0403  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.95 
 
 
297 aa  257  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07350  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.36 
 
 
336 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.31 
 
 
337 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.43 
 
 
328 aa  256  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  42.77 
 
 
344 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1330  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.96 
 
 
330 aa  255  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000518918  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.99 
 
 
337 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.44 
 
 
317 aa  255  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1578  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.34 
 
 
297 aa  255  8e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>