More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5829 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5829  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
324 aa  660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0197  putative sulfite oxidase subunit YedY  83.64 
 
 
322 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359289  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0560  putative sulfite oxidase subunit YedY  75.93 
 
 
317 aa  481  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0505928  normal  0.0124744 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2142  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.42 
 
 
330 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0157  putative sulfite oxidase subunit YedY  62.23 
 
 
321 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.337145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2734  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.04 
 
 
321 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2723  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.26 
 
 
325 aa  319  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1758  putative sulfite oxidase subunit YedY  50 
 
 
325 aa  317  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0627  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.91 
 
 
322 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000395521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2658  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.92 
 
 
311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708237  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.32 
 
 
319 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2134  putative sulfite oxidase subunit YedY  50 
 
 
302 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2049  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.54 
 
 
315 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00190211  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.91 
 
 
302 aa  295  9e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.26 
 
 
337 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.18 
 
 
333 aa  292  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.35 
 
 
337 aa  292  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  50.31 
 
 
337 aa  291  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.15 
 
 
337 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3750  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.18 
 
 
326 aa  291  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.677128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3696  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.32 
 
 
326 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.55 
 
 
341 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.84 
 
 
338 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0060  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.57 
 
 
330 aa  290  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.23 
 
 
337 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.25 
 
 
337 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.39 
 
 
366 aa  286  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2527  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.09 
 
 
345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.88 
 
 
333 aa  286  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.09 
 
 
366 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.09 
 
 
366 aa  285  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  49.09 
 
 
333 aa  285  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.01 
 
 
334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.93 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.92 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1893  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.2 
 
 
334 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.772909  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.71 
 
 
334 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0886  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.81 
 
 
324 aa  282  7.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00104567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  46.71 
 
 
334 aa  281  9e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  46.71 
 
 
334 aa  281  9e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.71 
 
 
334 aa  281  9e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.71 
 
 
334 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.71 
 
 
334 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.42 
 
 
334 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.45 
 
 
313 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1017  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.45 
 
 
317 aa  280  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.69 
 
 
331 aa  280  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0877  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.28 
 
 
322 aa  280  3e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.687916  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0576  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.77 
 
 
341 aa  279  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.73 
 
 
333 aa  279  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.87 
 
 
340 aa  279  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.47 
 
 
311 aa  278  8e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1981  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.61 
 
 
340 aa  277  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141842  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3640  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.33 
 
 
334 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000496426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3675  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.33 
 
 
334 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0647126  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3737  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.04 
 
 
334 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  0.0204641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3569  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.02 
 
 
334 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0584327  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3568  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.02 
 
 
334 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00040411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3690  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.59 
 
 
333 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.48 
 
 
313 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.22 
 
 
310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.65 
 
 
313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.78 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2345  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.05 
 
 
347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.18 
 
 
344 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.48 
 
 
344 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.33 
 
 
319 aa  271  9e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.33 
 
 
319 aa  271  9e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.13 
 
 
332 aa  271  9e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.31 
 
 
344 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.4 
 
 
316 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.71 
 
 
331 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.67 
 
 
298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2717  putative sulfite oxidase subunit YedY  42.51 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.61 
 
 
313 aa  269  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.18 
 
 
344 aa  269  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1462  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.37 
 
 
328 aa  269  5e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00391341  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5406  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.88 
 
 
337 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.92 
 
 
322 aa  267  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.4 
 
 
320 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2123  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.06 
 
 
336 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.31 
 
 
331 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3877  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.23 
 
 
306 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.6 
 
 
317 aa  266  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.91 
 
 
315 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.06 
 
 
331 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0428  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.42 
 
 
297 aa  265  8e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1578  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.42 
 
 
297 aa  265  8e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0403  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.42 
 
 
297 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2855  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.52 
 
 
315 aa  264  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.34 
 
 
328 aa  264  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.17 
 
 
331 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.31 
 
 
331 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.91 
 
 
344 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.35 
 
 
315 aa  263  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.97 
 
 
315 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62110  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.35 
 
 
337 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.91 
 
 
344 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.91 
 
 
344 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.91 
 
 
344 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>