55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1559 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1559  oxidoreductase molybdopterin binding protein  100 
 
 
168 aa  334  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0549  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  36.47 
 
 
171 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5339  oxidoreductase molybdopterin binding  35.26 
 
 
169 aa  100  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4047  oxidoreductase molybdopterin binding  37.25 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298645  normal  0.0635461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2345  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.48 
 
 
170 aa  97.1  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.194853  normal  0.901736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8654  hypothetical protein  38.89 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0978  hypothetical protein  43.88 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757282  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3706  hypothetical protein  30 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246828  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0450  hypothetical protein  32.34 
 
 
183 aa  62  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0192  molybdopterin oxidoreductase/precorrin-4 methylase  37 
 
 
607 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.620214  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2730  hypothetical protein  33.09 
 
 
159 aa  60.8  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2795  hypothetical protein  35.9 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1729  oxidoreductase molybdopterin binding  30.99 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.640414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0566  hypothetical protein  27.27 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1192  hypothetical protein  30.83 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.407182  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1263  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.71 
 
 
204 aa  51.6  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.07 
 
 
465 aa  50.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0191  precorrin-4 methylase  28.9 
 
 
556 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.57 
 
 
204 aa  48.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  30.5 
 
 
270 aa  47.8  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  31.97 
 
 
570 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2529  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.26 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  27.1 
 
 
453 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2207  hypothetical protein  34.69 
 
 
191 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  28.57 
 
 
420 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  31.61 
 
 
427 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.58 
 
 
414 aa  44.7  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2286  molybdopterin-binding oxidoreductase  36.28 
 
 
451 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0386813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0334  hypothetical protein  23.73 
 
 
170 aa  44.3  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0361924 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2579  oxidoreductase molybdopterin binding  29.79 
 
 
224 aa  44.3  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1990  hypothetical protein  28.69 
 
 
367 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  28.9 
 
 
407 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.54 
 
 
430 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  29.33 
 
 
409 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3454  hypothetical protein  28.81 
 
 
127 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  34.07 
 
 
374 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  28.57 
 
 
489 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  29.11 
 
 
431 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  30.23 
 
 
220 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  30.77 
 
 
425 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1665  oxidoreductase molybdopterin binding  35.4 
 
 
449 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1589  oxidoreductase molybdopterin binding  35.4 
 
 
445 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  32.28 
 
 
554 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  28.8 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.93 
 
 
451 aa  42.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  25.32 
 
 
414 aa  42.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  30.59 
 
 
361 aa  42  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.57 
 
 
200 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  30.71 
 
 
428 aa  41.6  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  30.71 
 
 
428 aa  41.6  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  27.56 
 
 
409 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  32.64 
 
 
258 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  31.2 
 
 
234 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  29.09 
 
 
430 aa  41.2  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  33.08 
 
 
338 aa  40.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>