20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5339 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5339  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
169 aa  342  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4047  oxidoreductase molybdopterin binding  49.4 
 
 
165 aa  167  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298645  normal  0.0635461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2345  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.9 
 
 
170 aa  166  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.194853  normal  0.901736 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1559  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.26 
 
 
168 aa  100  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2730  hypothetical protein  36.76 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0978  hypothetical protein  28.93 
 
 
159 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757282  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0549  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  31.9 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1729  oxidoreductase molybdopterin binding  29.75 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.640414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8654  hypothetical protein  30.71 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0626  hypothetical protein  27.59 
 
 
401 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.110542  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0192  molybdopterin oxidoreductase/precorrin-4 methylase  34.34 
 
 
607 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.620214  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  30.25 
 
 
349 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0566  hypothetical protein  31.62 
 
 
198 aa  44.7  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6601  hypothetical protein  37.36 
 
 
198 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1262  oxidoreductase molybdopterin binding  26.62 
 
 
367 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0450  hypothetical protein  24.18 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  27.81 
 
 
205 aa  42.4  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2564  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.2 
 
 
230 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3000  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.6 
 
 
198 aa  42  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  25.71 
 
 
234 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>