39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6601 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6601  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4633  hypothetical protein  65.15 
 
 
198 aa  285  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.381896 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0917  hypothetical protein  66.86 
 
 
200 aa  247  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1655  hypothetical protein  54.04 
 
 
195 aa  204  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3572  hypothetical protein  51.78 
 
 
196 aa  203  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2581  hypothetical protein  52.79 
 
 
192 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0546962  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0375  hypothetical protein  43.65 
 
 
214 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  30.82 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  29.46 
 
 
171 aa  62.8  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  28.1 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  30.65 
 
 
176 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  31.62 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  26.62 
 
 
167 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.8 
 
 
167 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.8 
 
 
167 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  26.8 
 
 
167 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  26.85 
 
 
166 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  26.85 
 
 
166 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  26.85 
 
 
166 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  24.56 
 
 
169 aa  55.1  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  24.68 
 
 
166 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  25.58 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  29.36 
 
 
167 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  28.32 
 
 
180 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.17 
 
 
166 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  26.83 
 
 
166 aa  51.6  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  30 
 
 
176 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  35.25 
 
 
175 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  28.57 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  22.67 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  27.22 
 
 
175 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3123  hypothetical protein  27.47 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  25 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  30.36 
 
 
175 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  23.57 
 
 
168 aa  45.1  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  26.67 
 
 
164 aa  44.7  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5339  oxidoreductase molybdopterin binding  36.56 
 
 
169 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  31.75 
 
 
176 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  26.92 
 
 
171 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>