54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0521 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  330  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  52.82 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  46.98 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  48.25 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  41.33 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  42.94 
 
 		 176 aa  131  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  36.59 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  43.54 
 
 		 168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  37.11 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3123  hypothetical protein  37.16 
 
 		 194 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  37.91 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  37.91 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  37.24 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  36.5 
 
 		 162 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  40 
 
 		 184 aa  94.4  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  36.03 
 
 		 173 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  38.79 
 
 		 171 aa  85.5  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  32.93 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  34.57 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  36.23 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.23 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.23 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  30.86 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  32.93 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  32.93 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  37.14 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  36.23 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  34.04 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0961  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.19 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  31.14 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06930  hypothetical protein  35.04 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2285  hypothetical protein  34.78 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0709741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26980  hypothetical protein  32.26 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  32.43 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3572  hypothetical protein  30.3 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  34.06 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  32.7 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6601  hypothetical protein  31.45 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  34.41 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000931  hypothetical protein  28.35 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4633  hypothetical protein  29.38 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.381896 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0917  hypothetical protein  27.5 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2581  hypothetical protein  27.78 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0546962  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1655  hypothetical protein  27.78 
 
 		 195 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.77 
 
 		 232 aa  45.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.96 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.47 
 
 		 200 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  28.43 
 
 		 201 aa  41.2  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  28.43 
 
 		 201 aa  41.2  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1559  hypothetical protein  28.36 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.759066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  33.09 
 
 		 407 aa  40.8  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0923  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.47 
 
 		 204 aa  40.8  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>