48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4742 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  344  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  45.52 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  38.81 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  36.36 
 
 		 160 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  34.01 
 
 		 166 aa  90.9  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0961  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.39 
 
 		 155 aa  90.9  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  34.01 
 
 		 166 aa  90.9  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  34.01 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  32.68 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  37.1 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  33.99 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  35.63 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  32.14 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  41.07 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  38.79 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.16 
 
 		 167 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  34.16 
 
 		 167 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.16 
 
 		 167 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  40.65 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  32.21 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  32.28 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  33.12 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.11 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  35.09 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  33.78 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  31.9 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  31.69 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  37.3 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  36.36 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  32.69 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  33.91 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  31.74 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  36.36 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2285  hypothetical protein  33.77 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0709741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26980  hypothetical protein  32.1 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06930  hypothetical protein  29.14 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  30.13 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  34.86 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6601  hypothetical protein  29.46 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000931  hypothetical protein  27.08 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4633  hypothetical protein  27.27 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.381896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1655  hypothetical protein  31.62 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3572  hypothetical protein  29.17 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0917  hypothetical protein  27.5 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3123  hypothetical protein  29.35 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1559  hypothetical protein  28.36 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.759066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2581  hypothetical protein  24.79 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0546962  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4188  hypothetical protein  26.04 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>