51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1772 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  359  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  86.11 
 
 
180 aa  304  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  78.68 
 
 
173 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  50.59 
 
 
166 aa  180  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  50 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  54.14 
 
 
156 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  50 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  50 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  50 
 
 
167 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  49.41 
 
 
166 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  49.41 
 
 
166 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  49.41 
 
 
166 aa  175  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  50 
 
 
167 aa  174  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.67 
 
 
166 aa  168  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  47.26 
 
 
164 aa  137  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  34.59 
 
 
162 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  35.12 
 
 
176 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  94.4  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  31.52 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  41.38 
 
 
184 aa  92  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  33.53 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  34.85 
 
 
171 aa  87.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  33.83 
 
 
167 aa  84  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  34.12 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  34.06 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  79  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  30.13 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0961  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.61 
 
 
155 aa  73.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  35.11 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  34.17 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06930  hypothetical protein  32.48 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000931  hypothetical protein  31.9 
 
 
151 aa  62.4  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26980  hypothetical protein  36.71 
 
 
162 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199345  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2285  hypothetical protein  35.44 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0709741  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3123  hypothetical protein  27.86 
 
 
194 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3572  hypothetical protein  27.92 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  27.34 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4633  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.381896 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0917  hypothetical protein  32.85 
 
 
200 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  28.74 
 
 
175 aa  54.7  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  28.14 
 
 
175 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2581  hypothetical protein  29.6 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0546962  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1559  hypothetical protein  29.69 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.759066 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6601  hypothetical protein  28.33 
 
 
198 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1655  hypothetical protein  28.44 
 
 
195 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  31.25 
 
 
258 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  24.37 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.71 
 
 
232 aa  42  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1990  hypothetical protein  30 
 
 
367 aa  41.6  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>