37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3572 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3572  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1655  hypothetical protein  53.37 
 
 		 195 aa  204  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6601  hypothetical protein  51.27 
 
 		 198 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4633  hypothetical protein  45.69 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.381896 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0917  hypothetical protein  49.7 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2581  hypothetical protein  49.48 
 
 		 192 aa  167  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0546962  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0375  hypothetical protein  43.78 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  36.3 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  32.22 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  30.3 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  35.9 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  35.9 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  30 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  30 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  27.32 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  28.89 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  27.98 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.08 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  31.62 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  29.48 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  31.86 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  30.43 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  29.32 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  28.74 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  29.51 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  29.17 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  26.19 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  27.92 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3123  hypothetical protein  26.81 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  27.11 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  27.11 
 
 		 175 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1194 aa  41.2  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  27.66 
 
 		 176 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>