52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3369 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
167 aa  347  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
167 aa  347  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
167 aa  347  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  95.21 
 
 
167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  92.22 
 
 
167 aa  327  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  90.42 
 
 
166 aa  298  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  80.84 
 
 
166 aa  286  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  84.08 
 
 
156 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  78.44 
 
 
166 aa  278  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  78.44 
 
 
166 aa  278  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  77.84 
 
 
166 aa  276  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  53.85 
 
 
180 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  55.56 
 
 
173 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  50 
 
 
176 aa  163  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  37.91 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  35.19 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  32.53 
 
 
167 aa  98.6  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  34.88 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  40.16 
 
 
184 aa  94.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  38.62 
 
 
166 aa  90.9  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  34.16 
 
 
171 aa  84.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  29.94 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  36.23 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  33.11 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  31.88 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  31.55 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0961  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.57 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  31.65 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  30.43 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3572  hypothetical protein  30 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  27.33 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  26.74 
 
 
168 aa  61.6  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4633  hypothetical protein  30.29 
 
 
198 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.381896 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06930  hypothetical protein  31.3 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  31.3 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  28.06 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  28.06 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  31.9 
 
 
155 aa  55.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000931  hypothetical protein  29.23 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2285  hypothetical protein  30.97 
 
 
162 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0709741  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6601  hypothetical protein  29.36 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1655  hypothetical protein  31.08 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26980  hypothetical protein  26.28 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199345  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0917  hypothetical protein  28.29 
 
 
200 aa  51.6  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2581  hypothetical protein  28.47 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0546962  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.62 
 
 
501 aa  44.3  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4188  hypothetical protein  25.49 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106008  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0014  oxidoreductase molybdopterin binding  27.05 
 
 
230 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  24.6 
 
 
218 aa  42  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  31.46 
 
 
233 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  31.48 
 
 
257 aa  41.2  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  28.93 
 
 
263 aa  40.8  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>