49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3349 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  76 
 
 
180 aa  245  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  73.25 
 
 
176 aa  229  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  50.87 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  50.29 
 
 
166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  50.29 
 
 
166 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  49.71 
 
 
166 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  50.29 
 
 
167 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  47.98 
 
 
167 aa  173  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.98 
 
 
167 aa  173  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.98 
 
 
167 aa  173  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  55.1 
 
 
156 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  49.1 
 
 
167 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.19 
 
 
166 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  42.14 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  35.06 
 
 
176 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  32.14 
 
 
162 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  35.09 
 
 
169 aa  97.4  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  39.52 
 
 
184 aa  95.5  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  34.13 
 
 
171 aa  92.4  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  39.29 
 
 
166 aa  92  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  35.92 
 
 
164 aa  91.3  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  35.37 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  28.31 
 
 
164 aa  88.6  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  31.48 
 
 
167 aa  87.8  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  32.16 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  32.91 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  36.13 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  30.19 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0961  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.99 
 
 
155 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  30.28 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  33.04 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06930  hypothetical protein  29.06 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  30.97 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  30.86 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  31.21 
 
 
155 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3572  hypothetical protein  32.14 
 
 
196 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000931  hypothetical protein  31.03 
 
 
151 aa  58.2  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6601  hypothetical protein  31.62 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2285  hypothetical protein  28.1 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0709741  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4633  hypothetical protein  31.75 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.381896 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26980  hypothetical protein  25.87 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199345  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2581  hypothetical protein  29.84 
 
 
192 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0546962  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0917  hypothetical protein  33.9 
 
 
200 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3123  hypothetical protein  23.68 
 
 
194 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1655  hypothetical protein  29.29 
 
 
195 aa  52.4  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1559  hypothetical protein  27.12 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.759066 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  32.28 
 
 
258 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  29.87 
 
 
218 aa  42  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>