45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1675 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  354  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  70.45 
 
 		 175 aa  243  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  69.32 
 
 		 175 aa  239  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0961  oxidoreductase, molybdopterin binding  40 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  38.1 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  39.33 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  35.5 
 
 		 168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  38.01 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  39.01 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  37.24 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  93.2  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  31.36 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  32.54 
 
 		 171 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  34.68 
 
 		 184 aa  87.8  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3123  hypothetical protein  29.89 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  34.15 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06930  hypothetical protein  29.71 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  34.53 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000931  hypothetical protein  26.81 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  33.09 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  28.4 
 
 		 167 aa  72  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  32.37 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  35.76 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  32.17 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  32.37 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  32.37 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  30.17 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.65 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  31.65 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.65 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  30.94 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.65 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  32.29 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2285  hypothetical protein  29.34 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0709741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26980  hypothetical protein  30.67 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  28.57 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  31.08 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  27.17 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1655  hypothetical protein  28.32 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.61 
 
 		 232 aa  48.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.82 
 
 		 200 aa  48.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6601  hypothetical protein  31.75 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3572  hypothetical protein  27.33 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>