41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06930 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06930  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  356  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000931  hypothetical protein  54.97 
 
 
151 aa  186  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  36.24 
 
 
155 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26980  hypothetical protein  34.59 
 
 
162 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199345  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2285  hypothetical protein  40.16 
 
 
162 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0709741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  32.52 
 
 
164 aa  84.3  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  33.55 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  35.2 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  35.14 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  34.21 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0961  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.03 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  35.04 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  29.71 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  31.15 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  36.84 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  32.8 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  33.93 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  31.67 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  33.04 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  31.19 
 
 
166 aa  67  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  29.14 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  28.75 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  31.68 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  32.17 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  27.68 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  28.75 
 
 
166 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  30.77 
 
 
180 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  28.75 
 
 
166 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.3 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.3 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  31.3 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  28.12 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  29.57 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  31.3 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  24.68 
 
 
160 aa  57.4  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  32.29 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  28.1 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.03 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3123  hypothetical protein  27.5 
 
 
194 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6601  hypothetical protein  21.92 
 
 
198 aa  41.2  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>