44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5601 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  344  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  64.88 
 
 		 168 aa  230  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  54.72 
 
 		 164 aa  186  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  39.62 
 
 		 176 aa  130  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  42.96 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  38.36 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  39.57 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  40.12 
 
 		 171 aa  120  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  39.86 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  38.3 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  34.73 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  34.73 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0961  oxidoreductase, molybdopterin binding  34 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  38.26 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  45.36 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  39.09 
 
 		 184 aa  85.1  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  33.58 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  32.12 
 
 		 164 aa  84.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  32.35 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26980  hypothetical protein  34.69 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06930  hypothetical protein  34.21 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  34.62 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2285  hypothetical protein  42.31 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0709741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3123  hypothetical protein  32.05 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000931  hypothetical protein  28.15 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  30.88 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  30.61 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  28.65 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  34.86 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  28.99 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  28.99 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  28.99 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  28.26 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  26.74 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.74 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  26.74 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.74 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  28.99 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.81 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1559  hypothetical protein  33.71 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.759066 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.53 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4188  hypothetical protein  26.51 
 
 		 181 aa  40.8  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106008  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  30.26 
 
 		 218 aa  40.8  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>