55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4734 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
164 aa  335  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  48.63 
 
 
180 aa  154  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  40 
 
 
166 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  45.86 
 
 
162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  47.26 
 
 
176 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.91 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.91 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  37.91 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  38.56 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  42.65 
 
 
173 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  39.86 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.58 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  40.14 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  46.76 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  43.07 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  35.8 
 
 
176 aa  100  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  37.68 
 
 
168 aa  100  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  39.39 
 
 
184 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  35.54 
 
 
168 aa  94.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  39.86 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  37.61 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  37.04 
 
 
175 aa  89.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  32.75 
 
 
169 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0961  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.87 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  36.36 
 
 
171 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  40 
 
 
171 aa  84.7  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  33.55 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  40.95 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06930  hypothetical protein  35.65 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  34.53 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  34.53 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  32.37 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  31.94 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000931  hypothetical protein  32.48 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2285  hypothetical protein  34.65 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0709741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26980  hypothetical protein  35.29 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199345  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3123  hypothetical protein  33.68 
 
 
194 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1559  hypothetical protein  28.35 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.759066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4633  hypothetical protein  33.64 
 
 
198 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.381896 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.1 
 
 
199 aa  48.5  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0917  hypothetical protein  30.84 
 
 
200 aa  47.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2581  hypothetical protein  26.67 
 
 
192 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0546962  normal  0.025304 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.98 
 
 
259 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6601  hypothetical protein  26.67 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.08 
 
 
243 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.03 
 
 
232 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1262  oxidoreductase molybdopterin binding  25.22 
 
 
367 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.86 
 
 
200 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4188  hypothetical protein  29.66 
 
 
181 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106008  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3572  hypothetical protein  25.74 
 
 
196 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2529  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.27 
 
 
181 aa  41.2  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1655  hypothetical protein  34.69 
 
 
195 aa  40.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  0.697334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>