44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3313 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  323  9e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  43.8 
 
 
184 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  41.84 
 
 
166 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  36.36 
 
 
171 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  33.58 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  45.36 
 
 
168 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  36.5 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  32.61 
 
 
169 aa  85.5  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  36.3 
 
 
171 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  34.81 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0961  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.33 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  34.67 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  40.91 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  27.63 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  34.72 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  38.89 
 
 
173 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  28.75 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  30.3 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  38.66 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  29.03 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  35.76 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3123  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  38.54 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  34.78 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.33 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  27.33 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.33 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  32.41 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  27.5 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  31.48 
 
 
166 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  31.48 
 
 
166 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  31.48 
 
 
166 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  32.67 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06930  hypothetical protein  24.68 
 
 
170 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.73 
 
 
166 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000931  hypothetical protein  23.4 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2285  hypothetical protein  30.77 
 
 
162 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0709741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26980  hypothetical protein  29.49 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199345  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1559  hypothetical protein  29.6 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.759066 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4188  hypothetical protein  26.52 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106008  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3462  oxidoreductase molybdopterin binding  30.91 
 
 
220 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167102  normal  0.590309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  30.83 
 
 
233 aa  40.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>