44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4053 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  343  7e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  46.06 
 
 
162 aa  157  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  55.43 
 
 
164 aa  114  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  33.54 
 
 
167 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  33.54 
 
 
156 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  33.54 
 
 
167 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  31.29 
 
 
166 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  32.53 
 
 
167 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.53 
 
 
167 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.53 
 
 
167 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  40.48 
 
 
184 aa  98.2  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  37.96 
 
 
176 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  39.29 
 
 
171 aa  94.7  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  30.06 
 
 
166 aa  94  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  30.06 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  31.29 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  38.26 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  34.31 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  34.78 
 
 
175 aa  89.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.85 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  32.93 
 
 
168 aa  87.8  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  32.08 
 
 
156 aa  87.8  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  34.51 
 
 
169 aa  84.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  32.85 
 
 
173 aa  84.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  40.65 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  33.81 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  36.09 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0961  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.18 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  34.81 
 
 
160 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  33.58 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  36.96 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  31.16 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2285  hypothetical protein  46.15 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0709741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26980  hypothetical protein  44.87 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199345  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000931  hypothetical protein  33.12 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  36.21 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06930  hypothetical protein  31.67 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  37.17 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  32.23 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3123  hypothetical protein  31.31 
 
 
194 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1559  hypothetical protein  29.73 
 
 
164 aa  51.2  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.759066 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4188  hypothetical protein  26.72 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106008  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1655  hypothetical protein  36.73 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4470  oxidoreductase molybdopterin binding  29.29 
 
 
201 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000629984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>