44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0961 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0961  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 		 155 aa  313  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0086  hypothetical protein  48.44 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1722  hypothetical protein  47.66 
 
 		 175 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1675  hypothetical protein  47.06 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0934134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2668  hypothetical protein  38.18 
 
 		 176 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1535  hypothetical protein  36.36 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.418999  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3132  hypothetical protein  38.4 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1522  hypothetical protein  37.01 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5601  hypothetical protein  34 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.971581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0914  hypothetical protein  37.31 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1061  hypothetical protein  40.65 
 
 		 171 aa  100  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4409  hypothetical protein  35.57 
 
 		 175 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4742  hypothetical protein  34.39 
 
 		 171 aa  90.9  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0657446  normal  0.278144 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2875  oxidoreductase molybdopterin binding  35.83 
 
 		 184 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4053  hypothetical protein  34.18 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4734  oxidoreductase molybdopterin binding  37.5 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06930  hypothetical protein  32.03 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0521  hypothetical protein  29.66 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  29.19 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3303  oxidoreductase molybdopterin binding  28.75 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482013  decreased coverage  0.00329734 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4898  hypothetical protein  31.88 
 
 		 180 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0558894 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0101  oxidoreductase molybdopterin binding  29.3 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.242171  normal  0.468495 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4799  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.57 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4147  oxidoreductase molybdopterin binding  28.57 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0617106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2285  hypothetical protein  29.38 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0709741  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3369  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.57 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0496244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2887  hypothetical protein  28.75 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0064  hypothetical protein  29.17 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00060183  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5221  oxidoreductase molybdopterin binding  28.85 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26980  hypothetical protein  31.25 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  28.57 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0956  hypothetical protein  29.63 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3349  oxidoreductase molybdopterin binding  28.47 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000852363 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000931  hypothetical protein  25.62 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5146  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.15 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1772  hypothetical protein  31.88 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421289  hitchhiker  0.00000126753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3123  hypothetical protein  29.05 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2079  oxidoreductase molybdopterin binding  30.12 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.393771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2124  oxidoreductase molybdopterin binding  30.12 
 
 		 201 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.117329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2401  oxidoreductase molybdopterin binding  30.12 
 
 		 201 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242306  normal  0.764459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3399  oxidoreductase molybdopterin binding  28.09 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>