53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1990 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1990  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  754    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3482  hypothetical protein  50.76 
 
 		 371 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0331  hypothetical protein  34.73 
 
 		 381 aa  209  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000115891  normal  0.150804 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3454  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1960  hypothetical protein  26.01 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.71 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.48 
 
 		 412 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  27.85 
 
 		 403 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  27.5 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  27.52 
 
 		 401 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  28.57 
 
 		 401 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4179  oxidoreductase molybdopterin binding  28.99 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0370615  unclonable  0.000000000255221 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  26.71 
 
 		 218 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  25 
 
 		 232 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  27.63 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.37 
 
 		 501 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.37 
 
 		 410 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03090  sulfite oxidase-like oxidoreductase  24.86 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.372289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  26.06 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  29.85 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  25.81 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  27.46 
 
 		 570 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0634  hypothetical protein  30 
 
 		 166 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  31.37 
 
 		 414 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  32 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  24.83 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  27.14 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1040  hypothetical protein  27.73 
 
 		 200 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.686628  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  28.43 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  34.78 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1559  oxidoreductase molybdopterin binding protein  24.84 
 
 		 168 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3134  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  25.3 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0673188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  32.08 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  26.16 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2579  oxidoreductase molybdopterin binding  27.69 
 
 		 224 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  34.78 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  33.66 
 
 		 229 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  29.58 
 
 		 554 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01006  Nitrate reductase [NADPH] (NR)(EC 1.7.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22945]  30.43 
 
 		 873 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  24.71 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1452  oxidoreductase molybdopterin binding  26.45 
 
 		 309 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  24.19 
 
 		 237 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  25.71 
 
 		 408 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  25 
 
 		 489 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.98 
 
 		 229 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  25.29 
 
 		 427 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0334  hypothetical protein  28.09 
 
 		 170 aa  43.1  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0361924 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0783  oxidoreductase molybdopterin binding subunit  28.67 
 
 		 166 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.76 
 
 		 406 aa  42.7  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1729  oxidoreductase molybdopterin binding  30.22 
 
 		 162 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.640414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4633  hypothetical protein  29.21 
 
 		 198 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.381896 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0795  hypothetical protein  28.67 
 
 		 166 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>