112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03090 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_03090  sulfite oxidase-like oxidoreductase  100 
 
 
272 aa  553  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.372289  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16780  sulfite oxidase-like oxidoreductase  48.58 
 
 
268 aa  195  8.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.610919 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0299  oxidoreductase molybdopterin binding  39.17 
 
 
270 aa  139  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1091  oxidoreductase molybdopterin binding  27.07 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000278852 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1014  oxidoreductase molybdopterin binding  29.19 
 
 
357 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0972537  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0394  oxidoreductase molybdopterin binding  27.97 
 
 
360 aa  86.7  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0656  oxidoreductase molybdopterin binding  29.21 
 
 
343 aa  82.4  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  0.0126108 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16790  sulfite oxidase-like oxidoreductase  29.13 
 
 
529 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.707001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.62 
 
 
501 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0298  oxidoreductase molybdopterin binding  26.2 
 
 
552 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  33.88 
 
 
546 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.53 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  31.78 
 
 
554 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.17 
 
 
512 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.96 
 
 
515 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  27.56 
 
 
414 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  29.91 
 
 
570 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  31.25 
 
 
531 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  31.25 
 
 
528 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  30.91 
 
 
523 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  31.13 
 
 
531 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  29.91 
 
 
538 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  29.71 
 
 
542 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.36 
 
 
525 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.37 
 
 
465 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.21 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03080  sulfite oxidase-like oxidoreductase  25.54 
 
 
535 aa  56.2  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0476411  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  26.21 
 
 
608 aa  55.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  27.78 
 
 
512 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.78 
 
 
512 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.78 
 
 
512 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0361  molybdopterin-binding oxidoreductase  27.4 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  26.63 
 
 
461 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  26.63 
 
 
461 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  27.4 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.19 
 
 
531 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  26.51 
 
 
420 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1452  oxidoreductase molybdopterin binding  30.41 
 
 
309 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952926  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.3 
 
 
511 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30 
 
 
545 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  26.09 
 
 
409 aa  53.1  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  28.43 
 
 
229 aa  52.8  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  26.92 
 
 
370 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0391  oxidoreductase molybdopterin binding  26.71 
 
 
231 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.3 
 
 
521 aa  52.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.62 
 
 
505 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26 
 
 
453 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  23.81 
 
 
369 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  27.08 
 
 
489 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1785  oxidoreductase molybdopterin binding protein  25.66 
 
 
200 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  30.48 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  26.23 
 
 
528 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.04 
 
 
520 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.42 
 
 
505 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  24.72 
 
 
361 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  25.41 
 
 
403 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  28.85 
 
 
534 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  24.86 
 
 
405 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  24.86 
 
 
405 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  25.51 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  25.41 
 
 
402 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1055  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.87 
 
 
202 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  24.58 
 
 
338 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.28 
 
 
508 aa  49.3  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  26.54 
 
 
369 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  28.04 
 
 
488 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.21 
 
 
509 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  24.81 
 
 
270 aa  49.3  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0393  oxidoreductase molybdopterin binding  25.13 
 
 
560 aa  48.9  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  25 
 
 
372 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  23.42 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  25.64 
 
 
505 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  22.63 
 
 
209 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  21.97 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1990  hypothetical protein  24.86 
 
 
367 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4200  oxidoreductase molybdopterin binding  27.35 
 
 
220 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483422  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  25.27 
 
 
401 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  26.79 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  24.86 
 
 
403 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  23.62 
 
 
431 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  20.07 
 
 
407 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  29.06 
 
 
220 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1906  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.52 
 
 
229 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0593419  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  27.48 
 
 
247 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  27.48 
 
 
247 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  25.2 
 
 
501 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  28.85 
 
 
247 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  25.86 
 
 
369 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  26.54 
 
 
369 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  26.03 
 
 
231 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  26.67 
 
 
524 aa  45.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.43 
 
 
221 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  23.72 
 
 
410 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  24.14 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  25.41 
 
 
402 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.62 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  23.97 
 
 
229 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  31.46 
 
 
437 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  28.37 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  23.72 
 
 
417 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>