13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1192 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1192  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  330  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.407182  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2795  hypothetical protein  66.9 
 
 
163 aa  210  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3706  hypothetical protein  34.51 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246828  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0566  hypothetical protein  30.41 
 
 
198 aa  67.4  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2207  hypothetical protein  40 
 
 
191 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0450  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3516  hypothetical protein  36.25 
 
 
174 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000323956  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1559  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.83 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.56 
 
 
414 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0978  hypothetical protein  30.65 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757282  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  28.57 
 
 
414 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  29.3 
 
 
427 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  28.3 
 
 
431 aa  41.2  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>