237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2061 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 251 aa  517  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  60.4 
 
 		 253 aa  310  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  56 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  53.78 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  53.6 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  52.34 
 
 		 261 aa  274  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  51 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  54.18 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  54.18 
 
 		 252 aa  271  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  54.18 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  52 
 
 		 261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  51.2 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  52.4 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  52 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  49.6 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  49.8 
 
 		 244 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  48.4 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  48.4 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  50.58 
 
 		 254 aa  244  9e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  50.19 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  50.19 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  47.62 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  49.2 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 		 262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  48 
 
 		 249 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  47.6 
 
 		 249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  48.8 
 
 		 249 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  46.75 
 
 		 266 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  48.57 
 
 		 246 aa  220  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  45.2 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  45.85 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  43.19 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  43.31 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  42.91 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  43.82 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  40.08 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  38 
 
 		 239 aa  161  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  39.69 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  38.96 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  38.55 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  35.86 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  37.05 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  36.47 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  32.55 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  34.38 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.85 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  25 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2246  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.34 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.169552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2146  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.34 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2359  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.34 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.371057 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2200  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.34 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.36 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2193  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.81 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.610513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.82 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2706  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.92 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.1 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.27 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.97 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24390  uroporphyrinogen-III synthase  27.66 
 
 		 558 aa  55.8  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.81 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  30.67 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.22 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.34 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.4 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1843  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.15 
 
 		 451 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.572708  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0043  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.63 
 
 		 462 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.69 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1297  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.77 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1227  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  28.04 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000574756  normal  0.766781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2524  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.57 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00515181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.22 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.53 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.44 
 
 		 500 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.63 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.03 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.7 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.23 
 
 		 490 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0768  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  29.11 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.4 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2152  precorrin-2 C20-methyltransferase  25 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014413  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  23.35 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.55 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1942  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  25.13 
 
 		 331 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2789  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.27 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000406105 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.54 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.9 
 
 		 482 aa  50.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0709  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.86 
 
 		 458 aa  49.7  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1853  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  28.4 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.254503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.07 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4696  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.31 
 
 		 478 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2052  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.6 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.754921 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1433  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.73 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5371  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.13 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160971  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1436  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.73 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1711  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.73 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.458847  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.73 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.7 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.66 
 
 		 463 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3265  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.42 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.12 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>