105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1321 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  100 
 
 		 246 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  54.88 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  56.18 
 
 		 253 aa  244  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  48.78 
 
 		 261 aa  231  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  50 
 
 		 252 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  48.78 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  47.56 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  46.53 
 
 		 254 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  48.57 
 
 		 251 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  47.76 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  47.58 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  51.76 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  51.76 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  51.76 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  47.2 
 
 		 261 aa  214  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  48.37 
 
 		 297 aa  214  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  46.94 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  46.53 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  51.82 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  47.98 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  51.01 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  46.53 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  46.53 
 
 		 249 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  51.84 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  47.97 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  48.36 
 
 		 244 aa  205  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  47.97 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  47.56 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  47.81 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  47.35 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  42.86 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  47.39 
 
 		 266 aa  191  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  50.81 
 
 		 262 aa  191  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  46.06 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  46.12 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  42.51 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  42.11 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  43.25 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  41.7 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  40.55 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  42.45 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  42.46 
 
 		 247 aa  148  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  43.5 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  41.98 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  41.56 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.19 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.48 
 
 		 236 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.57 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.05 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3147  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  32.64 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.452939  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0058  precorrin-2 C20-methyltransferase  20.94 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1297  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.94 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  31.51 
 
 		 516 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.59 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 		 502 aa  49.7  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  34.78 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0554  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.19 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.32 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1288  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.02 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0192  molybdopterin oxidoreductase/precorrin-4 methylase  28.57 
 
 		 607 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.620214  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1251  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.02 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2816  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.21 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0206  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  25 
 
 		 474 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3283  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  32.87 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2083  precorrin-2 methyltransferase  25 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.26 
 
 		 500 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.79 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.91 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.14 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4060  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.86 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.17 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  30 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0385  cobalt-factor II C20-methyltransferase  24.4 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0316  precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  31.91 
 
 		 511 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  24.54 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1355  cobalt-factor II C20-methyltransferase  27.59 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  23.23 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.93 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1988  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  25.68 
 
 		 474 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.45 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0118  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.66 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1163  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.46 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00204005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2111  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.46 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.414891  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.75 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1604  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.46 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.189665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0266  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.46 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0493785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1948  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.46 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1965  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.46 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00527923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0894  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.46 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19117  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  25 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1091  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  30 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.66 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3164  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  24.32 
 
 		 474 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7176  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.53 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789176  normal  0.206558 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.03 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1995  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  22.97 
 
 		 474 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.081337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2144  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  22.97 
 
 		 474 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.310632  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1321  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.17 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.47 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2175  bifunctional uroporphyrinogen-III methyltransferase/uroporphyrinogen-III synthase  22.97 
 
 		 474 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>