188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3385 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 252 aa  498  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  98.41 
 
 		 252 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  92.06 
 
 		 252 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  59.68 
 
 		 261 aa  292  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  54.18 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  60.48 
 
 		 256 aa  281  7.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  55.56 
 
 		 256 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  54.3 
 
 		 252 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  54.58 
 
 		 252 aa  272  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  56.97 
 
 		 254 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  57.37 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  63.01 
 
 		 262 aa  265  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  57.81 
 
 		 254 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  57.42 
 
 		 254 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  57.42 
 
 		 254 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  51.94 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  54.03 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  54.84 
 
 		 252 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  51.59 
 
 		 253 aa  248  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  54.44 
 
 		 253 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  51.39 
 
 		 244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  52.82 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  51.79 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  52.59 
 
 		 249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  54.65 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  49.6 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  51.01 
 
 		 246 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  52.21 
 
 		 249 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  51 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  48.41 
 
 		 254 aa  218  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  50.61 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  49.8 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  48.85 
 
 		 262 aa  204  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  46.83 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  50.4 
 
 		 249 aa  195  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  47.39 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  47.2 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  46.8 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  43.48 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  46.88 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  45.74 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  44.92 
 
 		 273 aa  158  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  43.15 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  44.49 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  37.09 
 
 		 242 aa  62  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.88 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2083  precorrin-2 methyltransferase  29.38 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.74 
 
 		 500 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.83 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  34.84 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.84 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.89 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.69 
 
 		 491 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.61 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.76 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.19 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  31.49 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.12 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2865  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  26.45 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.84 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.46 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2400  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.93 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0164224  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2990  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.97 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3542  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.77 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5690  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.93 
 
 		 255 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.23715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.03 
 
 		 258 aa  52  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  25.7 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.13 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0639  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  36.36 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0277633  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.57 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4696  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.09 
 
 		 478 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3020  precorrin-2 methyltransferase  26.71 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.04 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0036  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.56 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0701  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  27.38 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.73 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.09 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2111  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.34 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.414891  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0266  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.34 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0493785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1948  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.34 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1965  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.34 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00527923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0894  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.34 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.14 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.3 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1163  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.34 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00204005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1604  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.34 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.189665  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3145  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.26 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2359  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.25 
 
 		 203 aa  48.9  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.9 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.98 
 
 		 490 aa  48.9  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5371  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160971  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.4 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3100  precorrin-2 methyltransferase  25.66 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0768  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  26.32 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26510  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.86 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109383  normal  0.778787 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  25.27 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3265  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.27 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2250  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.41 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.44804  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.16 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>