160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2504 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  100 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  58.8 
 
 		 256 aa  281  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  55.02 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  49.8 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  54.62 
 
 		 249 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  53.01 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  52.16 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  51.98 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  49.2 
 
 		 261 aa  241  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  47.66 
 
 		 261 aa  241  7e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  47.83 
 
 		 252 aa  241  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  51 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  50.6 
 
 		 252 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  52.55 
 
 		 254 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  52.55 
 
 		 254 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  52.16 
 
 		 254 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  50 
 
 		 253 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  51.21 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  48 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  49 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  48 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  46.22 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  48.61 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  51.39 
 
 		 252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  51.39 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  51 
 
 		 252 aa  214  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  45.38 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  48.81 
 
 		 253 aa  211  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  48.36 
 
 		 246 aa  205  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  48.19 
 
 		 297 aa  204  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  48.41 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  46.75 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  45.75 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  41.27 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  43.7 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  39.37 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  41.86 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  42.45 
 
 		 239 aa  168  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  42.98 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  41.9 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  39.45 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  41.46 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  41.06 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  42.39 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  42.52 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.65 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  25 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  29.17 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  30.69 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  30.13 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1192  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.32 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0836971  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1672  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.32 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1271  precorrin-2 C20-methyltransferase  25 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1590  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.28 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.388218 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0799  precorrin-2 C20-methyltransferase  33.33 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.76 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.63 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6021  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.41 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179005  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1572  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.28 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.87 
 
 		 516 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1645  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.78 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839045  normal  0.484844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.32 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3283  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.27 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3477  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  31.13 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.33 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05231  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  29.03 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.81 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1375  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.61 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2990  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.04 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4822  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.88 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.525292 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.89 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.14 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1500  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.16 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.82 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  25 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.91 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.37 
 
 		 500 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24850  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.92 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7176  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.1 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789176  normal  0.206558 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0050  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  28.8 
 
 		 467 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.929104 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0459  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.1 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20999  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1229  precorrin-4 C11-methyltransferase  30.92 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0594011 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.99 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1314  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.12 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144548  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3265  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.92 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2496  precorrin-3B C17-methyltransferase  27 
 
 		 495 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218921 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24390  uroporphyrinogen-III synthase  28.04 
 
 		 558 aa  46.2  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2250  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.2 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.44804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.35 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26510  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.7 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109383  normal  0.778787 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0192  molybdopterin oxidoreductase/precorrin-4 methylase  30.32 
 
 		 607 aa  45.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.620214  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0476  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.08 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2865  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  27.97 
 
 		 234 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.52 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1163  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.43 
 
 		 244 aa  45.4  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00204005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1604  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.43 
 
 		 244 aa  45.4  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.189665  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1237  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.54 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.433092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0768  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  27.39 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.23 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  26.38 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>