184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2442 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 252 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  82.42 
 
 		 261 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  56.8 
 
 		 256 aa  292  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  53.78 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  52.4 
 
 		 253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  52 
 
 		 261 aa  268  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  55.2 
 
 		 251 aa  268  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  54.76 
 
 		 252 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  50.8 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  51.19 
 
 		 256 aa  262  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  54.37 
 
 		 252 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  54.3 
 
 		 252 aa  261  8e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  52.38 
 
 		 257 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  49.4 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  54.4 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  52 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  54.58 
 
 		 249 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  54.18 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  50.4 
 
 		 254 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  52.53 
 
 		 254 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  52.14 
 
 		 254 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  52.14 
 
 		 254 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  49.2 
 
 		 252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  46.8 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  47.83 
 
 		 244 aa  241  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  47.6 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  50 
 
 		 246 aa  229  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  50.2 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  45.38 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  44.8 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  48.65 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  45.95 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  45.14 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  41.11 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  41.04 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  39.76 
 
 		 254 aa  178  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  40.87 
 
 		 239 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  38.52 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  38.13 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  38.67 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  39.15 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  37.89 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  36.84 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  40.16 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  35.86 
 
 		 245 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.63 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.11 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2706  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.1 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0570  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.9 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.307877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0639  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.13 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.94 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2479  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.63 
 
 		 500 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04091  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.09 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5371  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.65 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160971  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3145  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.65 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26510  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.12 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109383  normal  0.778787 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.43 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2524  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.85 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00515181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2990  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.51 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1243  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.09 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0312  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.57 
 
 		 224 aa  52.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.71 
 
 		 233 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2250  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.02 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.44804  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04401  precorrin-2-C20-methyltransferase  23.78 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.63 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0289  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.23 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00797828  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3107  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  27.01 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1266  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.38 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  22.75 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1163  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.83 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00204005  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  22.98 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2111  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.83 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.414891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3283  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.18 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2135  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.34 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0352605 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1604  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.83 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.189665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0266  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.83 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0493785  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.68 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1948  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.83 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1965  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.83 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00527923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0894  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.83 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  25 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0704  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.34 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0385  cobalt-factor II C20-methyltransferase  22.11 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2314  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.96 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1853  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  29.87 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.254503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.48 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1689  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.63 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2400  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.3 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0164224  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  23.92 
 
 		 261 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0789  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.47 
 
 		 239 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194909  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4883  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.17 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.65 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1288  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.11 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0316  precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  25.77 
 
 		 511 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  28.12 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4617  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.47 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.449076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0036  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.4 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1251  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.11 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2190  precorrin-3B C17-methyltransferase  26.51 
 
 		 490 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.97 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00230836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>