147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1477 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1477  precorrin 6A synthase  100 
 
 		 254 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2819  precorrin 6A synthase  98.82 
 
 		 254 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1527  precorrin 6A synthase  84.23 
 
 		 245 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626854  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2542  precorrin 6A synthase  65.45 
 
 		 249 aa  295  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2920  precorrin 6A synthase  61.67 
 
 		 246 aa  282  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390694 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0332  precorrin 6A synthase  60.08 
 
 		 254 aa  275  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2224  precorrin 6A synthase  57.09 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5843  precorrin 6A synthase  57.25 
 
 		 265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6018  precorrin 6A synthase  45.45 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0516711  normal  0.289683 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2819  precorrin 6A synthase  45.49 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7173  precorrin 6A synthase  45.45 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92278  normal  0.266334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2387  precorrin 6A synthase  44.31 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4718  precorrin 6A synthase  46.27 
 
 		 254 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4338  precorrin 6A synthase  46.27 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0501476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4424  precorrin 6A synthase  46.27 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.753252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4583  precorrin 6A synthase  44.27 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2657  precorrin 6A synthase  44.66 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14068  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3763  precorrin 6A synthase  42.91 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.21445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2326  precorrin 6A synthase  43.08 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2104  precorrin 6A synthase  44.31 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2140  precorrin 6A synthase  43.87 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.1822  hitchhiker  0.0000632781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2000  precorrin 6A synthase  43.31 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3231  precorrin 6A synthase  41.83 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3174  precorrin 6A synthase  44.53 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1896  precorrin 6A synthase  42.23 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6988  precorrin 6A synthase  40 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3576  precorrin 6A synthase  47.22 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1538  precorrin 6A synthase  47.47 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0200089  normal  0.0986349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3385  precorrin 6A synthase  47.2 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.852211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2061  precorrin 6A synthase  38.58 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2709  tetrapyrrole methylase family protein  40.15 
 
 		 261 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2970  precorrin 6A synthase  43.19 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.590816  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3694  precorrin 6A synthase  46.8 
 
 		 252 aa  168  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.529674 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0142  precorrin 6A synthase  42.8 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2504  precorrin-6A synthase  41.87 
 
 		 244 aa  165  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.488753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3353  precorrin-6A synthase (deacetylating)  43.36 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2442  precorrin 6A synthase  38.58 
 
 		 252 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0256861  decreased coverage  0.000262915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4201  precorrin 6A synthase  39.6 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17580  precorrin 6A synthase  41.04 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1321  precorrin-6A synthase (deacetylating)  42.45 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0320  precorrin 6A synthase  41.92 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2879  precorrin 6A synthase  40.83 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0361  precorrin 6A synthase  40.08 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0784549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0376  precorrin 6A synthase  40.78 
 
 		 254 aa  118  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1612  precorrin-6A synthase (deacetylating)  40.89 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1556  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.66 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3502  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.46 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000438049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1897  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.72 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0153  precorrin-3B C17-methyltransferase  29.66 
 
 		 513 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2441  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.73 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161962  normal  0.0706437 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3652  precorrin-2 C20-methyltransferase  34.48 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2928  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.03 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493406  hitchhiker  0.00304132 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2610  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.56 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1313  precorrin-2 C20-methyltransferase  32 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3477  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.12 
 
 		 289 aa  52.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0768  precorrin-2 C20-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  27.46 
 
 		 232 aa  52  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2816  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.19 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3020  precorrin-2 methyltransferase  29.14 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2706  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.89 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1714  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.23 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1012  precorrin-2 C20-methyltransferase  23.78 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1433  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.52 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0316  precorrin-2 C20-methyltransferase / precorrin-3 methyltransferase  31.08 
 
 		 511 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1711  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.52 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.458847  normal  0.0168162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1436  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.52 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3100  precorrin-2 methyltransferase  28.08 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0476  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.14 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5690  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.45 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.23715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2152  precorrin-2 C20-methyltransferase  29.05 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014413  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2995  precorrin-2 C20-methyltransferase  31.72 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4875  precorrin-2 C20-methyltransferase  24.24 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1781  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.34 
 
 		 516 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629094  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6036  precorrin-2 C20-methyltransferase  30.2 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0693  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  28.29 
 
 		 172 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.152169  hitchhiker  0.0000247866 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0115  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.21 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.942057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1293  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.34 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.116679 
 
 
-
 
NC_004310  BR1288  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.85 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1163  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.06 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00204005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2111  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.06 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.414891  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0266  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.06 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0493785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1948  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.06 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1965  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.06 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00527923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0894  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.06 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2735  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.78 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2524  precorrin-2 C20-methyltransferase  32.21 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00515181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1251  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  25.85 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1710  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  24.31 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3118  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.97 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0803  precorrin-2 C20-methyltransferase  26.9 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.427355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2990  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.85 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6021  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.9 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0179005  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1604  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.06 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.189665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.51 
 
 		 484 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7176  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  26.9 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.789176  normal  0.206558 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3145  precorrin-2 C(20)-methyltransferase  27.22 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0995  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  23.3 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2826  precorrin-2 C20-methyltransferase  27.74 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0859499  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1853  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  26.06 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.254503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1522  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.05 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000310651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3374  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.16 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.299047 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>