123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_41479 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_41479  predicted protein  100 
 
 		 601 aa  1232    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36233  proton-dependent oligopeptide transporter, POT family  90.18 
 
 		 637 aa  1046    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02440  peptide transporter, putative  43.53 
 
 		 632 aa  445  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.369095  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08915  hypothetical peptide transporter (Eurofung)  41.3 
 
 		 606 aa  403  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42802  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08903  MFS peptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02550)  37.5 
 
 		 628 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01073  MFS peptide transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_1G12240)  33.69 
 
 		 601 aa  349  9e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03408  MFS peptide transporter Ptr2, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01490)  34.12 
 
 		 587 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70645  predicted protein  32.38 
 
 		 570 aa  304  4.0000000000000003e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0413957  normal  0.317652 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66905  predicted protein  30.58 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.705777 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47218  predicted protein  24.75 
 
 		 619 aa  95.9  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0405  amino acid/peptide transporter  24.51 
 
 		 458 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0035417  hitchhiker  0.00401498 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2147  proton-dependent oligopeptide transporter family protein  23.24 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4020  amino acid/peptide transporter  24.14 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4136  amino acid/peptide transporter  24.14 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4162  amino acid/peptide transporter  24.14 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1274  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  23.06 
 
 		 517 aa  81.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1599  oligopeptide transporter  22.47 
 
 		 522 aa  78.2  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.941268  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1598  amino acid/peptide transporter  22.82 
 
 		 451 aa  73.2  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1524  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  22.33 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.868386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  22.12 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  22.98 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  22.36 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  23.28 
 
 		 462 aa  67  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47148  predicted protein  23.92 
 
 		 775 aa  66.6  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2411  proton/peptide symporter family protein  22.22 
 
 		 517 aa  65.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  23.9 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  30.26 
 
 		 501 aa  63.5  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2667  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  22.33 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.63918  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  27.43 
 
 		 489 aa  62  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  26.61 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  24.26 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  27.51 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  28.03 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  30.05 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  30.05 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  30.05 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  27.62 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  27.62 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  26.16 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  26.89 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  28.71 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  21.38 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  21.38 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  21.34 
 
 		 509 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1438  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  25.58 
 
 		 683 aa  56.6  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  21.41 
 
 		 461 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  21.41 
 
 		 461 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  21.41 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  21.37 
 
 		 461 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  21.19 
 
 		 461 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  21.37 
 
 		 461 aa  54.7  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  21.37 
 
 		 461 aa  54.7  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  21.37 
 
 		 461 aa  54.7  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  26.14 
 
 		 483 aa  53.9  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  30.05 
 
 		 324 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  20.57 
 
 		 463 aa  53.5  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  25.6 
 
 		 502 aa  52.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  28.5 
 
 		 500 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  26 
 
 		 499 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  21.19 
 
 		 461 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1248  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  26.4 
 
 		 513 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0301309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  22.38 
 
 		 461 aa  51.6  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  26.64 
 
 		 533 aa  51.2  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  28.5 
 
 		 436 aa  50.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  23.93 
 
 		 506 aa  50.8  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0404  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  23.13 
 
 		 434 aa  50.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117264  hitchhiker  0.000442814 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  25.85 
 
 		 451 aa  50.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  28.08 
 
 		 498 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0002  proton/peptide symporter family protein  24.05 
 
 		 516 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  25.12 
 
 		 495 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  28.1 
 
 		 501 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0004  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.63 
 
 		 515 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  27.89 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  24.05 
 
 		 517 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  22.16 
 
 		 494 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  25.68 
 
 		 501 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  25.23 
 
 		 506 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  24.7 
 
 		 511 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  23.5 
 
 		 506 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  24.17 
 
 		 566 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3938  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.63 
 
 		 515 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4030  amino acid/peptide transporter  23.63 
 
 		 515 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  25.68 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  24.68 
 
 		 500 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  24.68 
 
 		 500 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  24.68 
 
 		 500 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1333  hypothetical protein  39.29 
 
 		 480 aa  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  28.29 
 
 		 496 aa  48.5  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  24.68 
 
 		 500 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  24.68 
 
 		 500 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  24.68 
 
 		 500 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  24.68 
 
 		 500 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  24.68 
 
 		 500 aa  48.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  24.68 
 
 		 500 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1329  hypothetical protein  39.29 
 
 		 480 aa  47.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2903  amino acid/peptide transporter  25.33 
 
 		 584 aa  47.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422026 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  25.1 
 
 		 467 aa  47  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  27.41 
 
 		 558 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  23.81 
 
 		 501 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  23.81 
 
 		 501 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>