286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2147 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2147  proton-dependent oligopeptide transporter family protein  100 
 
 		 478 aa  964    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1524  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  53.86 
 
 		 450 aa  469  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.868386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1599  oligopeptide transporter  53.21 
 
 		 522 aa  423  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.941268  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1248  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  44.98 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0301309  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0405  amino acid/peptide transporter  47.25 
 
 		 458 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0035417  hitchhiker  0.00401498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4162  amino acid/peptide transporter  46.37 
 
 		 456 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4136  amino acid/peptide transporter  46.37 
 
 		 456 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4020  amino acid/peptide transporter  46.15 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4021  amino acid/peptide transporter  43.33 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.925576  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4163  amino acid/peptide transporter  43.28 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.65473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4137  amino acid/peptide transporter  42.54 
 
 		 437 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.728655  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1598  amino acid/peptide transporter  38.5 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0404  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  43.32 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117264  hitchhiker  0.000442814 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2411  proton/peptide symporter family protein  37.62 
 
 		 517 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  35.94 
 
 		 517 aa  259  9e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0002  proton/peptide symporter family protein  35.35 
 
 		 516 aa  257  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3938  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  35.74 
 
 		 515 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4030  amino acid/peptide transporter  35.74 
 
 		 515 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0004  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  35.74 
 
 		 515 aa  250  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1274  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  37.64 
 
 		 517 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2667  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  38.11 
 
 		 521 aa  233  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.63918  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00673  oligopeptide transporter  51.22 
 
 		 284 aa  183  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340061  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70645  predicted protein  26.18 
 
 		 570 aa  152  8.999999999999999e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0413957  normal  0.317652 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03408  MFS peptide transporter Ptr2, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01490)  27.44 
 
 		 587 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66905  predicted protein  26.92 
 
 		 577 aa  139  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.705777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  28.67 
 
 		 479 aa  136  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  27.36 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  28.79 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  26.53 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  28.72 
 
 		 462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  27.36 
 
 		 461 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  28.97 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  27.59 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  28.36 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  27.38 
 
 		 446 aa  126  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  27.59 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  27.38 
 
 		 446 aa  126  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  27.34 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  27.34 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  27.34 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  27.59 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  27.34 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  27.34 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  27.34 
 
 		 461 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  27.59 
 
 		 461 aa  124  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  29.22 
 
 		 504 aa  123  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  27.34 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  25.67 
 
 		 501 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  26.23 
 
 		 501 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  26.23 
 
 		 501 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  29.82 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  26.46 
 
 		 501 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  26.42 
 
 		 463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  27.71 
 
 		 452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  27.71 
 
 		 452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  27.19 
 
 		 516 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  26.03 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  27.42 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  27.46 
 
 		 489 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  27.46 
 
 		 489 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  26.6 
 
 		 489 aa  117  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  25.94 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  25.75 
 
 		 489 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  30.45 
 
 		 533 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  25.12 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47148  predicted protein  28.12 
 
 		 775 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  26.63 
 
 		 489 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  26.54 
 
 		 464 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  26.52 
 
 		 490 aa  113  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08903  MFS peptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02550)  26.29 
 
 		 628 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50811  POT family transporter: dipeptide/tripeptide:proton  26.27 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.030888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  27.15 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  26.67 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  22.59 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  26.23 
 
 		 467 aa  110  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  25.39 
 
 		 511 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  28.14 
 
 		 449 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  26.19 
 
 		 501 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  27.27 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  27.27 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  27.89 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  25.79 
 
 		 499 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  24.06 
 
 		 516 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  25.06 
 
 		 510 aa  106  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  25.69 
 
 		 501 aa  106  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1438  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  34.52 
 
 		 683 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  26.68 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  25.3 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  27.2 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  26.2 
 
 		 488 aa  103  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  25.83 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  25.75 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  25.79 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  25.83 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  25.83 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  25.83 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  25.83 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  25.83 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  25.83 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  25.4 
 
 		 506 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>